Онлайн-среда химического моделирования (OCHEM): веб-платформа для хранения данных, разработки моделей и публикации химической информации

Онлайн-среда химического моделирования (OCHEM) представляет собой веб-платформу, предназначенную для автоматизации и упрощения типичных этапов, необходимых для моделирования количественных зависимостей «структура—активность» (QSAR). Платформа состоит из двух основных подсистем: базы данных экспериментальных измерений и среды моделирования. База данных, наполняемая пользователями, содержит инструменты для удобного ввода, поиска и редактирования тысяч записей. База данных OCHEM основана на принципе вики и ориентирована прежде всего на качество и проверяемость данных. База данных тесно интегрирована со средой моделирования, которая поддерживает все этапы, необходимые для создания прогностической модели: поиск данных; расчет и отбор широкого набора молекулярных дескрипторов; применение методов машинного обучения; валидацию; анализ модели; и оценку области применимости. В отличие от других подобных систем, OCHEM не предназначена для повторной реализации существующих инструментов или моделей; вместо этого она приглашает их первоначальных авторов вносить свои результаты, делать их общедоступными, обмениваться ими с другими пользователями и становиться участниками растущего научного сообщества. Наша цель — сделать OCHEM широко используемой платформой для проведения в интернете исследований количественных зависимостей «структура—свойство» (QSPR) и QSAR, а также для обмена их результатами с другими пользователями в Интернете. Конечная цель OCHEM — объединить все возможные хемоинформатические инструменты в одном простом, надежном и удобном для пользователя ресурсе. OCHEM бесплатна для веб-пользователей и доступна онлайн по адресу http://www.ochem.eu.