Современные тенденции в молекулярной диагностике дрожжевых инфекций: от ПЦР до секвенирования нового поколения

В последние годы увеличивается частота оппортунистических дрожжевых инфекций у человека. Эти инфекции трудно лечить и диагностировать, отчасти вследствие большого числа и широкого разнообразия видов, способных быть их причиной. Кроме того, всё чаще сообщается о резистентности инфицирующих штаммов к одному или нескольким противогрибковым препаратам, что существенно ограничивает возможности терапии и подчёркивает необходимость быстрого выявления возбудителя и определения профиля его чувствительности к лекарственным препаратам. Современные методы идентификации видов и устойчивости не обладают достаточной чувствительностью и специфичностью и часто требуют предварительного культивирования возбудителя, что задерживает постановку диагноза. Недавно разработанные высокопроизводительные технологии, такие как секвенирование нового поколения и протеомика, открывают совершенно новые возможности для более чувствительной, точной и быстрой диагностики дрожжевых патогенов. Эти подходы интенсивно изучаются, однако их внедрение в клиническую практику требует преодоления важных препятствий. В настоящем обзоре представлен обзор существующих и недавно появившихся подходов, которые могут применяться для идентификации дрожжевых патогенов и определения профилей их лекарственной устойчивости. В тексте освещаются преимущества и недостатки каждой методологии, а также обсуждаются наиболее перспективные разработки на пути от лабораторных исследований к клиническому применению.