Сведения о штаммах Bacillus anthracis, выделенных из вечной мерзлоты в тундровой зоне России
Insights from Bacillus anthracis strains isolated from permafrost in the tundra zone of Russia
2018-12-03
SCID: 54.1/4s7hmbfy
Discuss with AI
политомия A.Br.008/011линия B.Br.001/002Bacillus anthracisвечная мерзлотаполногеномное секвенирование
Figures from the paper
Abstract (AI)
В статье описаны штаммы Bacillus anthracis, выделенные во время вспышки сибирской язвы на полуострове Ямал летом 2016 года и независимо от этого в Якутии в 2015 году. Общей особенностью этих штаммов является их сохранение в вечной мерзлоте, откуда они были извлечены либо вследствие оттаивания мерзлоты (штаммы с Ямала), либо в результате палеонтологических раскопок (якутские штаммы). Все штаммы, выделенные на Ямале, имеют идентичный генотип, относящийся к линии B.Br.001/002, что указывает на общий источник инфекции на территории протяжённостью более 250 км. В отличие от этого, во время раскопок в Якутии из одной ямы были выделены три генетически различающихся штамма. Один из них, как и ямальские штаммы, относится к B.Br.001/002. Несмотря на удалённость Ямала от Якутии, анализ полногеномных последовательностей показал, что штаммы B.Br.001/002 находятся в очень близком родстве. Два других штамма относятся к двум разным ветвям A.Br.008/011 — одной из наиболее примечательных политомий, описанных к настоящему времени в популяции B. anthracis. Географическое распределение штаммов, относящихся к этой политомии, позволяет предположить, что она возникла в XIII веке одновременно с формированием единой Монгольской империи, простиравшейся от Китая до Восточной Европы. Мы предлагаем эволюционную модель недавней эволюции B. anthracis, согласно которой линия B распространилась по всей Евразии, а затем была вытеснена линией A, за исключением некоторых географически изолированных районов.
Key Findings
1
Штаммы B.Br.001/002 с Ямала и из Якутии оказались очень близкими родственниками, несмотря на географическую удалённость, согласно полногеномному секвенированию.
2
Предложенная эволюционная модель предполагает, что линия B распространилась по Евразии, а затем была вытеснена линией A, за исключением некоторых географически изолированных районов.
3
Два якутских штамма относятся к разным ветвям крупной политомии A.Br.008/011; её географическое распределение указывает на возникновение в XIII веке, во время существования Монгольской империи.
4
В ходе палеонтологических раскопок в Якутии из одной мерзлотной ямы были выделены три генетически различных штамма B. anthracis.
5
Штаммы, выделенные на полуострове Ямал во время вспышки сибирской язвы 2016 года, имеют идентичный генотип B.Br.001/002, что указывает на общий источник заражения на территории протяжённостью более 250 км.
Research Object
Штаммы Bacillus anthracis, выделенные из вечной мерзлоты в тундровых районах России, включая штаммы с полуострова Ямал и из Якутии
Research Subject
Генетическое разнообразие, филогенетическое родство, географическое распределение и недавняя эволюционная история этих штаммов
Publication Details
Publication Date
2018-12-03
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest