Переход к улучшенному надзору и более ранней диагностике водных патогенов: от традиционных методов к новым технологиям

Moving towards improved surveillance and earlier diagnosis of aquatic pathogens: From traditional methods to emerging technologies
Amy Ellison, Jo Cable, Scott MacAulay, Peter Kille
2022-03-19

диагностика изображений с помощью ИИ и наблюдение с дроновнадзор за водными патогенамидиагностика экологической ДНК (eDNA)изотермическая амплификация методом петлевой медиции (LAMP)портативное секвенирование следующего поколения (портативное NGS)
Ранняя и точная диагностика имеет ключевое значение для смягчения последствий инфекционных заболеваний наряду с эффективным надзором. Однако это особенно затруднено в водной среде из‑за скрытого биоразнообразия и физических ограничений. Традиционные методы диагностики, такие как визуальная диагностика и гистопатология, по‑прежнему широко используются, но технологические достижения, такие как портативное секвенирование следующего поколения (NGS) и искусственный интеллект (AI), всё чаще испытываются для ранней диагностики. Самые простые методики, основанные на визуальной диагностике, опираются на знания и опыт специалистов, но обеспечивают основу для надзора. Будущие вычислительные методы дистанционного зондирования, такие как диагностика изображений с помощью AI и наблюдение с дронов, в конечном итоге сократят трудозатраты при сохранении чувствительности, но потребуют капитальных и инфраструктурных вложений. Молекулярные методы быстро развивались за последние 30 лет: от стандартной ПЦР через петлевую изотермическую амплификацию (LAMP) до подходов NGS, предоставляя набор технологий, поддерживающих ныне популярную диагностику по окружной ДНК (eDNA). В настоящее время существует огромный потенциал для трансформационных изменений, обусловленных разработками в области медицинской диагностики человека. В данной работе мы сравниваем текущие технологии надзора и диагностики с теми, которые могут быть использованы или разработаны для применения в водной среде, по трём эталонным критериям: высокая чувствительность, специфичность, оперативность диагностики и экономическая эффективность.
1
Методы удалённого зондирования на базе ИИ и наблюдение с дронов могут снизить затраты на труд без потери чувствительности, но требуют капитальных вложений и инфраструктуры.
2
Сравнение существующих и потенциальных технологий с идеалами (высокая чувствительность, специфичность, оперативность и экономичность) показывает значительный трансформационный потенциал применения достижений в медицине человека для надзора за водными патогенами.
3
Ранняя и точная диагностика вместе с эффективным надзором необходимы для снижения последствий инфекционных заболеваний водных организмов, но особенно затруднены в водной среде из‑за скрытого биоразнообразия и физических ограничений.
4
Появляющиеся технологии — портативный NGS, ИИ (диагностика по изображениям), дроны для наблюдения и молекулярные методы, такие как LAMP и eDNA — тестируются и обещают более раннюю и чувствительную диагностику.
5
Традиционные методы диагностики (визуальная диагностика, гистопатология) по‑прежнему широко используются и служат основой надзора, но зависят от опыта и знаний специалистов.

Диагностические и надзорные технологии для водных патогенов в водной среде

Эффективность и пригодность методов (традиционная визуальная диагностика/гистопатология, молекулярные методы включая PCR/LAMP/eDNA/NGS и новые технологии, такие как портативный NGS, AI‑диагностика по изображениям и дроновый надзор) для более ранней диагностики и улучшенного мониторинга, оцениваемые по чувствительности, специфичности, скорости и экономической эффективности

Publication Details
Publication Date
2022-03-19
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
99
Access Type
Author Information
Authors
Amy Ellison
Jo Cable
Scott MacAulay
Peter Kille
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%