Глобальный эпистаз на ландшафтах приспособленности

Global epistasis on fitness landscapes
Juan Díaz‐Colunga, Abigail Skwara, Karna Gowda, Ramón Díaz‐Uriarte, Mikhail Tikhonov, Djordje Bajić, Álvaro Sánchez
2023-04-02

адаптивные траекторииэпистатические взаимодействияпредсказание эволюцииландшафты приспособленностиглобальный эпистаз
Эпистатические взаимодействия между мутациями существенно усложняют адаптивные ландшафты и часто рассматриваются как фактор, затрудняющий прогнозирование эволюции. Однако закономерности глобального эпистаза, при котором эффект мутации на приспособленность хорошо предсказывается приспособленностью её генетического фона, могут, напротив, помочь в реконструкции ландшафтов приспособленности и выявлении адаптивных траекторий. Глобальный эпистаз может возникать вследствие микроскопических взаимодействий между мутациями или присущей ландшафту приспособленности нелинейности. В этом кратком обзоре мы даём сжатый обзор последних исследований глобального эпистаза, уделяя особое внимание формированию интуитивного понимания причин его частого наблюдения. Для этого мы сопоставляем простые геометрические рассуждения с недавними математическими анализами и с их помощью объясняем, почему разные мутации в эмпирическом ландшафте могут демонстрировать различные закономерности глобального эпистаза — от убывающей до возрастающей отдачи. Наконец, мы рассматриваем нерешённые вопросы и перспективные направления исследований. Статья входит в тематический выпуск «Междисциплинарные подходы к прогнозированию эволюционной биологии».
1
Геометрические рассуждения и математический анализ объясняют, почему разные мутации в эмпирическом ландшафте могут демонстрировать различные паттерны, включая убывающую и возрастающую отдачу.
2
Глобальный эпистаз описывает случаи, когда эффект мутации на приспособленность хорошо предсказывается приспособленностью её генетического фона, что может улучшать прогнозирование эволюции.
3
Микроскопические взаимодействия между мутациями и внутренние нелинейности ландшафтов приспособленности могут порождать наблюдаемые паттерны глобального эпистаза.
4
Обзор обобщает современные исследования глобального эпистаза и выделяет открытые вопросы для реконструкции ландшафтов приспособленности и определения адаптивных траекторий.

ландшафты приспособленности с эпистатическими взаимодействиями между мутациями

возникновение и вариативность паттернов глобального эпистаза, включая убывающую и возрастающую отдачу, а также их значение для реконструкции ландшафтов приспособленности и вывода адаптивных траекторий

Publication Details
Publication Date
2023-04-02
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
79
Access Type
Author Information
Authors
Juan Díaz‐Colunga
Abigail Skwara
Karna Gowda
Ramón Díaz‐Uriarte
Mikhail Tikhonov
Djordje Bajić
Álvaro Sánchez
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%