Первичный протеомный анализ зрелых семян ячменя и солода

Несколько сортов ячменя (Hordeum vulgare) используют для производства солода в пивоварении. Качество солода зависит от сорта, условий его выращивания и хранения, а также от промышленного процесса. Для углубления исследований качества солода был проведён протеомный анализ семян ячменя и солода. Протеомный анализ включал двумерный (2-D) гель-электрофорез, масс-спектрометрию и биоинформатику для идентификации отдельных белков. На начальном этапе проект был сосредоточен на белках, представленных в основных пятнах в диапазоне нейтральных изоэлектрических точек (pI 4–7), включая отдельные пятна, различавшиеся у четырёх сортов ячменя. В качестве референсного использовали высококачественный пивоваренный сорт ячменя Barke. Различия между сортами в картинах пятен на 2-D гелях наблюдались как на уровне семян, так и на уровне солода. В экстрактах семян одним из белков, обусловливающих вариации, был идентифицирован ингибитор альфа-амилазы/трипсина. В экстрактах солода были идентифицированы различные формы изофермента 2 альфа-амилазы, представленные в характерных для разных сортов картинах пятен. В результате идентификации белков в основных пятнах на 2-D гелях в экстракте зрелых семян были обнаружены 27 различных белков в 42 пятнах, тогда как при анализе 13 различных пятен соответствующего экстракта солода были идентифицированы только три специфических белка. Предполагается, что посттрансляционная обработка приводит к присутствию одного и того же белка в разных пятнах.