Популяционная структура и геномная характеристика местных пород свиней России, Беларуси, Казахстана и Украины

Введение: Общепринято считать, что одомашнивание свиней происходило в нескольких регионах Евразии; породы, происходящие из Европы и Азии, изучены достаточно хорошо. Однако генетическая структура пород свиней России, Беларуси, Казахстана и Украины, представляющих обширные географические территории и разнообразные климатические зоны Евразии, остается в значительной степени неизвестной. Результаты: В данном исследовании впервые проведено геномное обследование 170 свиней, представляющих 13 пород России, Беларуси, Казахстана и Украины; для сравнения также были включены 288 свиней шести китайских и семи европейских пород. Полученные результаты показывают, что 13 впервые исследованных пород произошли преимущественно от европейских свиней в результате сложной примеси линий крупной белой породы, ландраса, дюрока, гемпшира и других пород, причем они не демонстрируют географической структуры, основанной на генетических расстояниях. Кроме того, у миниатюрных сибирских свиней (порода Минисиб) из России выявлен значительный азиатский вклад. За исключением пород Минисиб, уржумской, украинской степной рябой и украинской степной белой, которые, возможно, подвергались интенсивному инбридингу, исследованные породы характеризовались относительно высоким генетическим разнообразием и низким уровнем гомозиготности по сравнению с китайскими аборигенными породами свиней. Заключение: В данном исследовании впервые представлен геномный обзор популяционной структуры и генетического разнообразия 13 репрезентативных пород свиней России, Беларуси, Казахстана и Украины; эта информация будет полезна для сохранения и рационального управления данными породами.