Идентификация птиц с помощью ДНК-штрихкодов

Короткие последовательности ДНК из стандартизированного участка генома образуют ДНК-штрихкод, позволяющий идентифицировать виды. Создание общедоступной библиотеки ДНК-штрихкодов, связанных с образцами, имеющими названия, может предоставить новый универсальный ключ для идентификации видов; его эффективность будет возрастать по мере расширения таксономического охвата и появления более быстрых и дешёвых методов секвенирования. Недавние исследования показывают, что разнообразие последовательностей в участке митохондриального гена цитохром-с-c-оксидазы I длиной 648 п. н. (COI) может использоваться в качестве ДНК-штрихкода для идентификации видов животных. В настоящем исследовании проверена эффективность COI-штрихкода для различения видов птиц — одной из наиболее крупных и хорошо изученных групп позвоночных. Мы определили COI-штрихкоды для 260 видов североамериканских птиц и обнаружили, что различать виды в целом было достаточно просто. Все виды имели отличный COI-штрихкод или набор COI-штрихкодов, а различия между близкородственными видами в среднем в 18 раз превышали различия внутри видов. Наши результаты позволили выявить четыре вероятных новых вида североамериканских птиц, что указывает на возможность обнаружения многих дополнительных видов при глобальном исследовании. Выявление значительных различий между видами в последовательностях COI по сравнению с небольшими различиями внутри видов подтверждает эффективность COI-штрихкодов для идентификации видов птиц. Этот результат, наряду с результатами исследований других групп животных, позволяет предположить, что стандартный порог различий последовательностей при скрининге — 10-кратное среднее внутривидовое различие — может ускорить открытие новых видов животных. Накопленные свидетельства эффективности ДНК-штрихкодов как основы для идентификации видов поддерживают международную инициативу, недавно начавшую формирование всеобъемлющей библиотеки последовательностей COI, связанных с образцами, имеющими названия.