Молекулярные механизмы регуляции экспрессии генов Pcdh-γ: доказательства в пользу модели множественных промоторов и цис-альтернативного сплайсинга

Геномная организация кластеров генов протокадгеринов (Pcdh) имеет поразительное сходство с организацией кластеров генов иммуноглобулинов и Т-клеточных рецепторов и потенциально может обеспечивать значительное молекулярное разнообразие. Гены Pcdh активно экспрессируются в центральной нервной системе. Эти молекулы являются основными кандидатами на роль факторов, обеспечивающих установление специфических нейронных связей. Несмотря на многочисленные исследования геномной структуры кластеров генов Pcdh человека и мыши, окончательно установленные молекулярные механизмы, контролирующие экспрессию Pcdh, по-прежнему неизвестны. Были предложены четыре теории: (1) рекомбинация ДНК с последующим цис-сплайсингом, (2) один промотор и цис-альтернативный сплайсинг, (3) множественные промоторы и цис-альтернативный сплайсинг и (4) множественные промоторы и транс-сплайсинг. Сочетая молекулярный и генетический анализ, мы оценили эти четыре модели в локусе Pcdh-γ. Наш анализ свидетельствует о том, что транскрипция отдельных генов Pcdh-γ контролируется отличающимся, но родственным промотором, расположенным выше каждого вариабельного экзона Pcdh-γ, а посттранскрипционная обработка каждого транскрипта Pcdh-γ преимущественно осуществляется посредством цис-альтернативного сплайсинга.