Расширение биотехнологического потенциала лактобацилл посредством сравнительной геномики 213 штаммов и родственных родов
Expanding the biotechnology potential of lactobacilli through comparative genomics of 213 strains and associated genera
2015-09-29
SCID: 54.1/7w5drb7r
Discuss with AI
последовательности геномов 213 штаммов Lactobacillusсравнительная геномика Lactobacillusгены биотрансформации углеводов и белковновые системы CRISPR-Cas у лактобациллфилогеномная структура для классификации видов
Figures from the paper
Abstract (AI)
Лактобациллы представляют собой разнообразную группу видов, занимающих питательно богатые ниши, связанные с человеком, животными, растениями и пищевыми продуктами. Они широко используются в биотехнологии и пищевой консервации и изучаются как потенциальные терапевтические агенты. Использование лактобацилл осложняют метаболическое разнообразие, неясная идентичность видов и неопределённые отношения между ними и другими коммерчески важными молочнокислыми бактериями. Способность лактобацилл к биотрансформациям является неисчерпанным биотехнологическим ресурсом. Здесь мы представляем последовательности геномов 213 штаммов Lactobacillus и родственных родов и их закодированный генетический каталог для модификации углеводов и белков. Кроме того, мы описываем широкое и разнообразное присутствие новых систем иммунитета CRISPR–Cas у лактобацилл, которые могут быть использованы для редактирования генома. Мы даём объяснение филогеномному распределению факторов взаимодействия с хозяином и бактериоцинoв, влияющих на их естественную и промышленную среду, а также механизмов выживания при стрессах в технологических процессах. Мы представляем надёжную филогеномную основу для существующих видов и для классификации новых видов.
Key Findings
1
Разработана надёжная филогеномная структура для разрешения существующих видовых отношений и классификации новых видов Lactobacillus.
2
Были получены и проанализированы геномные последовательности 213 штаммов Lactobacillus и родственных родов.
3
В lactobacilli обнаружены новые и широко распространённые системы иммунитета CRISPR-Cas, представляющие потенциал для редактирования генома.
4
Филогеномный анализ уточняет распределение факторов взаимодействия с хозяином, бактериоцинов и механизмов устойчивости к стрессу, важных в природной и промышленной среде.
5
Геномы предоставляют генетический каталог ферментов lactobacilli, модифицирующих углеводы и белки, раскрывая потенциал биотрансформаций для биотехнологии.
Research Object
Геномы 213 штаммов рода Lactobacillus и родственных родов
Research Subject
Сравнительно-геномная характеристика генетических возможностей по модификации углеводов и белков, обнаружению новых систем CRISPR–Cas, факторов взаимодействия с хозяином, бактериоцинов, механизмов устойчивости к стрессу и построению филогеномной структуры для классификации видов с целью расширения биотехнологического потенциала
Publication Details
Publication Date
2015-09-29
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest