ScanImage: гибкое программное обеспечение для управления лазерными растровыми микроскопами

Актуальность: лазерная растровая микроскопия является мощным инструментом для анализа структуры и функции биологических образцов. Несмотря на наличие многочисленных коммерческих лазерных растровых микроскопов, для некоторых наиболее интересных и сложных приложений требуется индивидуальная разработка. Основным препятствием для кастомизации является сложность создания собственного оборудования для сбора данных и написания сложного программного обеспечения, необходимого для управления лазерным растровым микроскопом. Результаты: мы описываем простой программный подход к управлению лазерным растровым микроскопом без необходимости в специализированном оборудовании для сбора данных. Сбор данных и управление растровым сканированием реализуются с помощью стандартных плат сбора данных. Вся нагрузка по интеграции сигналов и обработке изображений возлагается на центральный процессор компьютера. Мы количественно оцениваем эффективность нашего алгоритма сбора данных и кондиционирования сигналов при различных условиях. Мы реализовали подход в пакете программ с открытым исходным кодом (ScanImage) и описываем его функциональность. Выводы: представлен ScanImage — программное обеспечение для управления гибким лазерным растровым микроскопом, позволяющее легко выполнять индивидуальную конфигурацию.