Митохондриальный геном пресноводной медузы Craspedacusta sowerbyi и филогенетика Medusozoa

Определена нуклеотидная последовательность длиной 17 922 пары оснований (п. о.) линейной молекулы митохондриальной ДНК (мтДНК) пресноводной медузы Craspedacusta sowerbyi (Hydrozoa, Trachylina, Limnomedusae). Эта последовательность характеризуется неожиданно низким содержанием A+T (57,1%) и содержит гены 13 белков энергетического обмена, рРНК малой и большой субъединиц, а также тРНК метионина и триптофана. В C. sowerbyi выявлен предковый порядок генов медузозоев (AMGO), аналогичный порядку, обнаруженному у Cubaia aphrodite (Hydrozoa, Trachylina, Limnomedusae), дискомедузных Scyphozoa и Staurozoa. Гены мтДНК C. sowerbyi организованы в два кластера с противоположной полярностью транскрипции, причем транскрипция направлена к концам молекулы ДНК. Концы молекулы митохондриальной ДНК фланкированы идентичными инвертированными терминальными повторами (ITR) — признаком, характерным для медузозоев. Кроме того, ниже гена рРНК большой субъединицы обнаружены две открытые рамки считывания (ORF) длиной 354 и 1611 п. о., сходные с ORF ORF314 и polB, выявленными в линейной мтДНК C. aphrodite, дискомедузных Scyphozoa и Staurozoa. Филогенетический анализ C. sowerbyi и других книдарий проведен на основе как нуклеотидных, так и выведенных аминокислотных последовательностей 13 митохондриальных генов энергетического обмена. Рабочая гипотеза подтверждает монофилию Medusozoa и его положение как сестринской группы по отношению к Octocorallia (Cnidaria, Anthozoa). В составе Medusozoa филогенетический анализ предполагает, что Staurozoa может быть наиболее рано отделившимся классом и сестринской группой всех остальных медузозоев. Cubozoa и коронатные Scyphozoa образуют кладу, являющуюся сестринской группой по отношению к Hydrozoa и дискомедузным Scyphozoa. Hydrozoa является сестринской группой дискомедузных Scyphozoa. Semaeostomeae представляет собой парафилетическую кладу по отношению к Rhizostomeae, тогда как Limnomedusae (Trachylina) является сестринской группой гидроидолин и может быть наиболее рано отделившейся линией внутри Hydrozoa.