Контрастные признаки роста численности популяции для митохондриальной ДНК и Y-хромосом среди человеческих популяций Африки

История расширения популяций в плейстоцене была реконструирована на основании спектра частот полиморфизма митохондриальной ДНК (мтДНК) у многих человеческих популяций. Подобные закономерности обычно не наблюдаются для аутосомных локусов и локусов, сцепленных с X-хромосомой. Одним из объяснений этого несоответствия может быть недавнее сокращение численности популяции, после которого гаплоидные и аутосомные локусы восстанавливались с разной скоростью вследствие различий в эффективной численности популяций. Согласно этой гипотезе, митохондриальная ДНК и ДНК Y-хромосомы должны демонстрировать сходное смещение спектра частот в популяциях, недавно переживших увеличение эффективной численности. Мы проверили эту гипотезу, повторно секвенировав 6,6 кб некодирующей ДНК Y-хромосомы и 780 пар оснований гена субъединицы III цитохром-c-оксидазы (COIII) митохондриальной ДНК у 172 мужчин из пяти африканских популяций. Для каждого локуса в каждой популяции применяли четыре теста расширения популяции: статистику Fs Фу, статистику R(2), коалесцентные симуляции и распределение несовпадений. В соответствии с предыдущими результатами, закономерности полиморфизма мтДНК лучше описывались моделью постоянной численности популяции у популяций, занимающихся собирательством, и моделью расширения популяции у производящих пищу популяций. Напротив, ни один из тестов не выявил признаков роста численности по Y-хромосоме ни у популяций, занимающихся собирательством, ни у производящих пищу популяций. Различия в картинах полиморфизма мтДНК и Y-хромосомы, вероятнее всего, отражают полоспецифичные демографические процессы в недавней истории африканских популяций. Мы предполагаем, что во время экспансии банту, происходившей в течение последних 5 000 лет, мужчины характеризовались меньшей эффективной численностью популяции и/или более низкими темпами миграции.