Проксимальные мутации в центре типа 1 с медью лакказы CotA: спектроскопическая, окислительно-восстановительная, кинетическая и структурная характеристика мутантов I494A и L386A

Proximal mutations at the type 1 copper site of CotA laccase: spectroscopic, redox, kinetic and structural characterization of I494A and L386A mutants
Paulo Durão, Zhenjia Chen, Catarina S. Silva, Cláudio M. Soares, Manuela M. Pereira, Smilja Todorović, Peter Hildebrandt, Isabel Bento, Peter F. Lindley, Lı́gia O. Martins
2008-05-09

лакказа CotAмутанты I494A и L386Aрентгеновская кристаллографиярезонансная рамановская спектроскопиямедный центр типа 1
В настоящем исследовании в лакказе CotA из Bacillus subtilis были заменены два гидрофобных остатка, расположенных вблизи медного центра типа 1. Замена Leu(386) на остаток аланина, по-видимому, вызывает лишь очень незначительные изменения свойств фермента, что указывает на минимальные изменения структуры медных центров. Однако замена Ile(494) на аланин приводит к существенным изменениям фермента. Так, основная полоса видимого поглощения смещается на 16 нм, до 625 нм, и характеризуется повышенной интенсивностью, тогда как интенсивность плеча при приблизительно 330 нм уменьшается в два раза. Моделирование спектра ЭПР мутанта I494A выявляет различия как в медном центре типа 1, так и в медном центре типа 2, отражающие изменения геометрии этих центров. Средневзвешенные по интенсивности частоты, рассчитанные по спектрам резонансного комбинационного рассеяния, составляют 410 см(-1) для фермента дикого типа и 396 см(-1) для мутанта I494A, что указывает на увеличение длины связи Cu–S в медном центре типа 1 мутанта. В целом полученные данные однозначно свидетельствуют о том, что мутация Ile(494) вызывает значительное изменение структуры вблизи медного центра типа 1; это было подтверждено рентгеновской кристаллографией. Кристаллическая структура показывает наличие пятого лиганда — молекулы растворителя — в медном центре типа 1, что приводит к приблизительно тригонально-бипирамидальной геометрии. Окислительно-восстановительные потенциалы мутантов L386A и I494A смещены в отрицательную сторону приблизительно на 60 и 100 мВ соответственно. Эти изменения хорошо коррелируют со снижением каталитической эффективности обоих мутантов по сравнению с ферментом дикого типа.
1
I494A изменяет геометрию медных центров типа 1 и типа 2, что показано моделированием спектров ЭПР.
2
Мутация I494A существенно изменяет фермент: основная полоса поглощения смещается на 16 нм, до 625 нм, и увеличивает интенсивность.
3
Мутация L386A вызывает лишь незначительные спектроскопические и структурные изменения, указывая на минимальное воздействие на медные центры CotA-лакказы.
4
Интенсивность-взвешенная частота в спектрах комбинационного рассеяния уменьшается с 410 см⁻¹ у дикого типа до 396 см⁻¹ у I494A, что указывает на удлинение связи Cu–S в центре типа 1.
5
Рентгеновская кристаллография выявляет пятую, растворитель-ную лиганду у центра меди типа 1 мутанта I494A, формирующую приблизительно тригонально-бипирамидальную геометрию; окислительно-восстановительные потенциалы снижаются примерно на 60 мВ для L386A и на 100 мВ для I494A, что коррелирует с уменьшением каталитической эффективности.

Лаκказа CotA из Bacillus subtilis, включая мутанты I494A и L386A с мутациями вблизи медного центра типа 1

Влияние мутаций близлежащих гидрофобных остатков на структуру медных центров, спектроскопические и окислительно-восстановительные свойства, а также каталитическую эффективность лаκказы CotA

Publication Details
Publication Date
2008-05-09
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Paulo Durão
Zhenjia Chen
Catarina S. Silva
Cláudio M. Soares
Manuela M. Pereira
Smilja Todorović
Peter Hildebrandt
Isabel Bento
Peter F. Lindley
Lı́gia O. Martins
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%