Проксимальные мутации в центре типа 1 с медью лакказы CotA: спектроскопическая, окислительно-восстановительная, кинетическая и структурная характеристика мутантов I494A и L386A
Proximal mutations at the type 1 copper site of CotA laccase: spectroscopic, redox, kinetic and structural characterization of I494A and L386A mutants
2008-05-09
SCID: 54.1/aw3znn6r
Discuss with AI
лакказа CotAмутанты I494A и L386Aрентгеновская кристаллографиярезонансная рамановская спектроскопиямедный центр типа 1
Figures from the paper
Abstract (AI)
В настоящем исследовании в лакказе CotA из Bacillus subtilis были заменены два гидрофобных остатка, расположенных вблизи медного центра типа 1. Замена Leu(386) на остаток аланина, по-видимому, вызывает лишь очень незначительные изменения свойств фермента, что указывает на минимальные изменения структуры медных центров. Однако замена Ile(494) на аланин приводит к существенным изменениям фермента. Так, основная полоса видимого поглощения смещается на 16 нм, до 625 нм, и характеризуется повышенной интенсивностью, тогда как интенсивность плеча при приблизительно 330 нм уменьшается в два раза. Моделирование спектра ЭПР мутанта I494A выявляет различия как в медном центре типа 1, так и в медном центре типа 2, отражающие изменения геометрии этих центров. Средневзвешенные по интенсивности частоты, рассчитанные по спектрам резонансного комбинационного рассеяния, составляют 410 см(-1) для фермента дикого типа и 396 см(-1) для мутанта I494A, что указывает на увеличение длины связи Cu–S в медном центре типа 1 мутанта. В целом полученные данные однозначно свидетельствуют о том, что мутация Ile(494) вызывает значительное изменение структуры вблизи медного центра типа 1; это было подтверждено рентгеновской кристаллографией. Кристаллическая структура показывает наличие пятого лиганда — молекулы растворителя — в медном центре типа 1, что приводит к приблизительно тригонально-бипирамидальной геометрии. Окислительно-восстановительные потенциалы мутантов L386A и I494A смещены в отрицательную сторону приблизительно на 60 и 100 мВ соответственно. Эти изменения хорошо коррелируют со снижением каталитической эффективности обоих мутантов по сравнению с ферментом дикого типа.
Key Findings
1
I494A изменяет геометрию медных центров типа 1 и типа 2, что показано моделированием спектров ЭПР.
2
Мутация I494A существенно изменяет фермент: основная полоса поглощения смещается на 16 нм, до 625 нм, и увеличивает интенсивность.
3
Мутация L386A вызывает лишь незначительные спектроскопические и структурные изменения, указывая на минимальное воздействие на медные центры CotA-лакказы.
4
Интенсивность-взвешенная частота в спектрах комбинационного рассеяния уменьшается с 410 см⁻¹ у дикого типа до 396 см⁻¹ у I494A, что указывает на удлинение связи Cu–S в центре типа 1.
5
Рентгеновская кристаллография выявляет пятую, растворитель-ную лиганду у центра меди типа 1 мутанта I494A, формирующую приблизительно тригонально-бипирамидальную геометрию; окислительно-восстановительные потенциалы снижаются примерно на 60 мВ для L386A и на 100 мВ для I494A, что коррелирует с уменьшением каталитической эффективности.
Research Object
Лаκказа CotA из Bacillus subtilis, включая мутанты I494A и L386A с мутациями вблизи медного центра типа 1
Research Subject
Влияние мутаций близлежащих гидрофобных остатков на структуру медных центров, спектроскопические и окислительно-восстановительные свойства, а также каталитическую эффективность лаκказы CotA
Publication Details
Publication Date
2008-05-09
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest