Криоэлектронно-микроскопический анализ спайкового белка коронавируса кошек выявляет уникальную структуру и маскирующие гликаны

Вирус инфекционного перитонита кошек (FIPV) — альфакоронавирус, вызывающий почти 100%-ную летальность при отсутствии эффективного лечения. В настоящей работе представлена структура спайкового (S) белка FIPV серотипа I, полученная методом криоэлектронной микроскопии (крио-ЭМ) с разрешением 3,3 Å; этот белок отвечает за распознавание хозяина и проникновение вируса в клетку. Методом масс-спектрометрии были определены сайт-специфические составы плотно распределённых высокоманнозных N-гликанов и N-гликанов сложного типа, которые составляют 1/4 общей молекулярной массы; большинство N-гликанов удалось визуализировать методом крио-ЭМ. В частности, N-гликаны, вклинивающиеся между двумя галектиноподобными доменами в составе субъединицы S1 белка S FIPV, обусловливают уникальную пропеллероподобную конформацию, подчёркивая важность гликозилирования для поддержания структуры белка. Сайт расщепления в субъединице S2, отвечающий за активацию, также продемонстрировал отличительные структурные особенности и гликозилирование. Эти структурные данные создают основу для более глубокого молекулярного понимания патогенеза инфекционного перитонита кошек.