Градиент аффинности к ATP формирует асимметричный «рабочий ход», приводящий в движение цикл сворачивания шаперонина TRiC/CCT

A Gradient of ATP Affinities Generates an Asymmetric Power Stroke Driving the Chaperonin TRIC/CCT Folding Cycle
Judith Frydman, Anne S. Meyer, Stefanie Reißmann, Łukasz A. Joachimiak, Anthony T. Nguyen, Bryan Chen
2012-10-01

градиент сродства к ATPхаперонин TRiC/CCTасимметричное использование ATPнаправленный «удар мощности» при сворачиваниигетеро-олигомерное двукольцевое строение
Эукариотический шаперонин TRiC/CCT использует цикл ATP для сворачивания многих жизненно важных белков, которые другие шапероны не могут свернуть. Этот 1 МДа гетероолигомер состоит из двух идентичных сложенных колец, собранных из восьми паралогичных субъединиц, каждая из которых содержит консервативную домен связывания ATP. В настоящей работе мы сообщаем о резкой асимметрии в цикле использования ATP этого кольцеобразного шаперонина, несмотря на его внешне симметричную архитектуру. Только четыре из восьми различных субъединиц связывают ATP при физиологических концентрациях. Связывание и гидролиз ATP низкоаффинными субъединицами полностью избыточны для функции TRiC in vivo. Консервативная иерархия связывания нуклеотида среди субъединиц TRiC эволюционно модулируется за счёт различий в контактах с нукозидами. Поразительно, что высоко- и низкоаффинные субъединицы пространственно сегрегированы в пределах двух смежных полушарий в кольце, что создаёт асимметричный «рабочий ход», приводящий в движение цикл сворачивания. Этот необычный режим использования ATP, вероятно, служит для координации направленного механизма, лежащего в основе уникальной способности TRiC/CCT сворачивать сложные эукариотические белки.
1
Связывание и гидролиз ATP субодиницами с низким сродством полностью несущественны для функции TRiC in vivo.
2
Субъединицы с высоким и низким сродством пространственно сегрегированы в две смежные полусферы внутри каждого кольца.
3
Только четыре из восьми паралогичных субъединиц связывают ATP при физиологических концентрациях.
4
Хаперонин TRiC/CCT демонстрирует драматическую асимметрию в использовании ATP, несмотря на симметричную архитектуру кольца.
5
Сохранённая иерархия связывания нуклеотида эволюционно модулируется за счёт различий в контактах с нукозидом между субъединицами.
6
Гемисферная сегрегация сродств к ATP создаёт асимметричный «удар силы», который приводит в движение цикл сворачивания TRiC и, вероятно, обеспечивает направленный механизм сворачивания сложных эукариотических белков.

Эукариотический шаперонин TRiC/CCT (гетеро-олигомерный 1 МДа комплекс из двух колец, каждое собрано из восьми паралогичных субъединиц)

Асимметричное использование АТФ между субъединицами — градиент сродства к АТФ, пространственная сегрегация высоко- и низкосвязующих субъединиц в две смежные «полусферы» и вытекающий из этого асимметричный рабочий ход, приводящий цикл сворачивания белков TRiC/CCT

Publication Details
Publication Date
2012-10-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Judith Frydman
Anne S. Meyer
Stefanie Reißmann
Łukasz A. Joachimiak
Anthony T. Nguyen
Bryan Chen
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%