Профилирование длинных некодирующих РНК и мРНК при карциноме околощитовидной железы

Карцинома околощитовидной железы (PCa) представляет собой редкое эндокринное новообразование, обычно характеризующееся неблагоприятным исходом. Вклад длинных некодирующих РНК (lncRNAs) в развитие злокачественных и доброкачественных опухолей околощитовидной железы остаётся в значительной степени неизвестным. В настоящем исследовании изучали транскриптомные профили экспрессии lncRNA и мРНК в 6 образцах PCa, 6 образцах аденомы околощитовидной железы (PAd) и 4 образцах нормальной околощитовидной железы (PaN). В общей сложности между PCa и PAd были выявлены дифференциально экспрессируемые 2641 транскрипт lncRNA и 2165 транскриптов мРНК. Анализ обогащения показал, что дерегулированные транскрипты преимущественно участвуют во взаимодействии внеклеточного матрикса (ECM) с рецепторами и путях энергетического обмена. Биоинформатический анализ позволил предположить, что ATF3, ID1, FOXM1, EZH2 и MITF могут играть ключевую роль в канцерогенезе околощитовидной железы. Кластерный анализ с использованием теста серий распределил дифференциально экспрессируемые lncRNAs и мРНК по нескольким моделям профилей экспрессии; среди них для построения сети коэкспрессии был выбран профиль «плато», отражающий компоненты, специфичные для канцерогенеза околощитовидной железы. Для валидации методом количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR) были отобраны семь lncRNAs и три мРНК в 16 образцах PCa, 41 образце PAd и 4 образцах PaN. Анализ характеристических кривых показал, что площадь под кривой для lncRNA PVT1 и GLIS2-AS1 составила 0,871 и 0,860 соответственно. Более высокие сигналы гибридизации наблюдались в PCa для PVT1 и в PAd для GLIS2-AS1. В заключение имеющиеся данные указывают на то, что PAd и PCa частично имеют общие сигнальные молекулы и пути, но характеризуются независимыми транскрипционными событиями. Дифференциально экспрессируемые lncRNAs и мРНК взаимодействуют сложным образом и участвуют в опухолеобразовании околощитовидной железы. lncRNAs PVT1 и GLIS2-AS1 могут быть новыми потенциальными маркерами для диагностики PCa.