Эпистаз ограничивает мутационные пути адаптации гемоглобина у высокогорных пищух

Epistasis Constrains Mutational Pathways of Hemoglobin Adaptation in High-Altitude Pikas
Danielle M. Tufts, Chandrasekhar Natarajan, Inge Grønvall Revsbech, Joana Projecto-Garcia, Federico G. Hoffmann, Roy E. Weber, Angela Fago, Hideaki Moriyama, Jay F. Storz
2014-11-18

реконструкция предкового белкаэпистазсродство гемоглобина к O2высокогорные пищухимутационные пути
Фундаментальный вопрос эволюционной генетики заключается в роли мутационной плейотропии и эпистаза в формировании траекторий эволюции белков. Наиболее непосредственно этот вопрос можно исследовать с помощью сайт-направленного мутагенеза, изучая ландшафт мутационных изменений функции белка в экспериментально определённых областях пространства последовательностей. В настоящей работе мы оцениваем, как плейотропные компромиссы и эпистатические взаимодействия влияют на доступность альтернативных мутационных путей в ходе адаптивной эволюции функции гемоглобина (Hb) у высокогорных пищух (Mammalia: Lagomorpha). Сочетая воскрешение предкового белка с комбинаторным подходом к белковой инженерии, мы исследовали функциональные эффекты последовательных мутационных шагов во всех возможных путях, приводивших к повышению сродства Hb к O2. Эти эксперименты показали, что эффекты мутаций на сродство Hb к O2 в значительной степени зависят от временного порядка их возникновения: каждая из трёх замен в β-цепи вызывала значимое повышение сродства Hb к O2 на предковом генетическом фоне, однако две из этих замен давали противоположные эффекты, когда возникали на более поздних этапах пути. Эксперименты выявили повсеместный эпистаз в отношении сродства Hb к O2, однако мутации, изменяющие сродство, не вызывали значимых плейотропных компромиссов. Эти результаты дают представление о свойствах адаптивных замен в белках, эволюционировавших естественным образом, и позволяют предположить, что доступность альтернативных мутационных путей может сильнее ограничиваться эпистазом знака для биохимических фенотипов, подвергавшихся положительному отбору, чем антагонистической плейотропией.
1
Замены, изменяющие сродство, не вызывали значимых плейотропных компромиссов, поэтому антагонистическая плейотропия существенно не ограничивала эти пути.
2
Альтернативные мутационные пути, вероятно, сильнее ограничивались эпистазом со сменой знака для отбираемого биохимического признака, чем плейотропными компромиссами.
3
Каждая из трёх замен в β-цепи значительно повышала сродство гемоглобина к кислороду на предковом фоне, но две из них давали противоположный эффект при более позднем возникновении.
4
Эффекты мутаций на сродство к кислороду сильно зависели от порядка их появления, что выявило повсеместный эпистаз со сменой знака.
5
В исследовании реконструировали предковый гемоглобин и проверили все последовательные мутационные пути, ведущие к повышению сродства к кислороду у пищух высокогорья.

функция гемоглобина (Hb) у пищух высокогорья, включая предковые и сконструированные варианты Hb

влияние последовательных замен в β-цепи, включая эпистатические взаимодействия, доступность мутационных путей и плейотропные компромиссы, на сродство Hb к O2

Publication Details
Publication Date
2014-11-18
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Danielle M. Tufts
Chandrasekhar Natarajan
Inge Grønvall Revsbech
Joana Projecto-Garcia
Federico G. Hoffmann
Roy E. Weber
Angela Fago
Hideaki Moriyama
Jay F. Storz
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%