Эпистаз ограничивает мутационные пути адаптации гемоглобина у высокогорных пищух
Epistasis Constrains Mutational Pathways of Hemoglobin Adaptation in High-Altitude Pikas
2014-11-18
SCID: 54.1/bt3qy8xz
Discuss with AI
реконструкция предкового белкаэпистазсродство гемоглобина к O2высокогорные пищухимутационные пути
Figures from the paper
Abstract (AI)
Фундаментальный вопрос эволюционной генетики заключается в роли мутационной плейотропии и эпистаза в формировании траекторий эволюции белков. Наиболее непосредственно этот вопрос можно исследовать с помощью сайт-направленного мутагенеза, изучая ландшафт мутационных изменений функции белка в экспериментально определённых областях пространства последовательностей. В настоящей работе мы оцениваем, как плейотропные компромиссы и эпистатические взаимодействия влияют на доступность альтернативных мутационных путей в ходе адаптивной эволюции функции гемоглобина (Hb) у высокогорных пищух (Mammalia: Lagomorpha). Сочетая воскрешение предкового белка с комбинаторным подходом к белковой инженерии, мы исследовали функциональные эффекты последовательных мутационных шагов во всех возможных путях, приводивших к повышению сродства Hb к O2. Эти эксперименты показали, что эффекты мутаций на сродство Hb к O2 в значительной степени зависят от временного порядка их возникновения: каждая из трёх замен в β-цепи вызывала значимое повышение сродства Hb к O2 на предковом генетическом фоне, однако две из этих замен давали противоположные эффекты, когда возникали на более поздних этапах пути. Эксперименты выявили повсеместный эпистаз в отношении сродства Hb к O2, однако мутации, изменяющие сродство, не вызывали значимых плейотропных компромиссов. Эти результаты дают представление о свойствах адаптивных замен в белках, эволюционировавших естественным образом, и позволяют предположить, что доступность альтернативных мутационных путей может сильнее ограничиваться эпистазом знака для биохимических фенотипов, подвергавшихся положительному отбору, чем антагонистической плейотропией.
Key Findings
1
Замены, изменяющие сродство, не вызывали значимых плейотропных компромиссов, поэтому антагонистическая плейотропия существенно не ограничивала эти пути.
2
Альтернативные мутационные пути, вероятно, сильнее ограничивались эпистазом со сменой знака для отбираемого биохимического признака, чем плейотропными компромиссами.
3
Каждая из трёх замен в β-цепи значительно повышала сродство гемоглобина к кислороду на предковом фоне, но две из них давали противоположный эффект при более позднем возникновении.
4
Эффекты мутаций на сродство к кислороду сильно зависели от порядка их появления, что выявило повсеместный эпистаз со сменой знака.
5
В исследовании реконструировали предковый гемоглобин и проверили все последовательные мутационные пути, ведущие к повышению сродства к кислороду у пищух высокогорья.
Research Object
функция гемоглобина (Hb) у пищух высокогорья, включая предковые и сконструированные варианты Hb
Research Subject
влияние последовательных замен в β-цепи, включая эпистатические взаимодействия, доступность мутационных путей и плейотропные компромиссы, на сродство Hb к O2
Publication Details
Publication Date
2014-11-18
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest