Панраковый одноклеточный анализ выявляет гетерогенность и пластичность фибробластов, ассоциированных с раком, в опухолевом микроокружении

Фибробласты, ассоциированные с раком (CAF), являются преобладающими компонентами опухолевого микроокружения (TME) и влияют на признаки рака, однако их универсальные характеристики для различных типов рака не были систематически исследованы. В настоящей работе проведён панраковый анализ 226 образцов 10 типов солидных опухолей для профилирования TME на уровне отдельных клеток, что позволило выявить общие свойства и пластичность гетерогенных CAF. Траектория активации основных типов CAF была разделена на три состояния, характеризующиеся различными взаимодействиями с другими клеточными компонентами и связью с прогнозом эффективности иммунотерапии. Кроме того, минорные компоненты CAF имели альтернативное происхождение из других компонентов TME, таких как эндотелиальные клетки и макрофаги. В частности, повсеместное присутствие CAF, возникающих в результате эндотелиально-мезенхимального перехода, которые могут взаимодействовать с расположенными поблизости SPP1+ опухоль-ассоциированными макрофагами, связано с эндотелиально-мезенхимальным переходом и стратификацией выживаемости. В нашем исследовании комплексно охарактеризованы общие свойства и динамика CAF, а также подчёркнуты их гетерогенность и пластичность в различных типах рака. Браузер интегрированной панраковой одноклеточной информации доступен по адресу https://gist-fgl.github.io/sc-caf-atlas/.