От метагеномики к палеогеномике: крупномасштабное секвенирование ДНК мамонта

Мы секвенировали 28 миллионов пар оснований ДНК с использованием метагеномного подхода и образца шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius) из Сибири. Благодаря исключительной сохранности образца и применению недавно разработанной техники эмульсионной полимеразной цепной реакции и пиросеквенирования 13 миллионов пар оснований (45,4%) прочитанных последовательностей были идентифицированы как ДНК мамонта. Идентичность последовательностей между полученными нами данными и данными по африканскому слону (Loxodonta africana) составила 98,55%, что согласуется с датой дивергенции 5–6 миллионов лет назад, установленной на основе палеонтологических данных. Образец содержал удивительно низкое разнообразие ДНК окружающей среды. Высокая доля эндогенной ДНК, которую можно извлечь из этого единственного образца мамонта, позволила бы завершить секвенирование его генома, открыв путь к развитию палеогеномики.