Эпистаз высокого порядка формирует эволюционные траектории

High-order epistasis shapes evolutionary trajectories
Zachary R. Sailer, Michael J. Harms
2017-05-15

эволюционные траекторииландшафт приспособленностикарты генотип–приспособленностьэпистаз высокого порядкавзаимодействия мутаций
Эпистаз высокого порядка, при котором эффект мутации определяется взаимодействиями с двумя или более другими мутациями, вносит небольшой, но обнаружимый вклад в карты «генотип—приспособленность». Хотя эпистаз между парами мутаций, как известно, является важным фактором, определяющим эволюционные траектории, эволюционные последствия эпистаза высокого порядка остаются недостаточно изученными. Чтобы определить влияние эпистаза высокого порядка на эволюционные траектории, мы вычислительным методом удалили эпистаз высокого порядка из экспериментальных карт «генотип—приспособленность», содержащих все бинарные комбинации пяти мутаций. Затем мы сравнили траектории на картах с эпистазом высокого порядка и без него. Мы обнаружили, что эпистаз высокого порядка существенно влияет на доступность и вероятность эволюционных траекторий. Более детальный анализ показал, что воздействие на эволюционные траектории определяется величиной эпистаза, а не его порядком. Кроме того, мы установили, что эпистаз высокого порядка делает невозможным прогнозирование эволюционных траекторий на основе индивидуальных и попарных эффектов мутаций. Поэтому мы заключаем, что эпистаз высокого порядка оказывает глубокое влияние на эволюционные траектории в картах «генотип—приспособленность».
1
Удаление эпистаза высокого порядка показало, что он существенно изменяет доступность и вероятность эволюционных траекторий.
2
Несмотря на меньшую изученность по сравнению с попарным эпистазом, эпистаз высокого порядка существенно формирует эволюцию в картах «генотип–приспособленность».
3
Эпистаз высокого порядка вносит небольшой, но обнаружимый вклад в карты «генотип–приспособленность», содержащие комбинации пяти мутаций.
4
Эпистаз высокого порядка препятствует надежному предсказанию эволюционных траекторий только по индивидуальным и попарным эффектам мутаций.
5
Влияние эпистаза на эволюционные траектории определяется скорее его величиной, чем порядком взаимодействия.

экспериментальные карты «генотип–приспособленность», содержащие все бинарные комбинации пяти мутаций

влияние эпистаза высокого порядка на доступность, вероятность и предсказуемость эволюционных траекторий в картах «генотип–приспособленность»

Publication Details
Publication Date
2017-05-15
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Zachary R. Sailer
Michael J. Harms
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%