DeePMD-kit v2: программный пакет для моделей глубокого потенциала
DeePMD-kit v2: A software package for deep potential models
2023-08-01
SCID: 54.1/cytjszw4
Discuss with AI
DP-range коррекцияDeep Potential (DP) моделиDeepPot-SEдескрипторы на основе вниманиясжатие модели
Figures from the paper
Abstract (AI)
DeePMD-kit — мощный программный пакет с открытым исходным кодом, облегчающий выполнение молекулярно-динамических симуляций с использованием машинно-обучаемых потенциалов, известных как модели Deep Potential (DP). Пакет, впервые выпущенный в 2017 году, получил широкое применение в физике, химии, биологии и материаловедении для изучения атомистических систем. Текущая версия DeePMD-kit включает многочисленные продвинутые возможности, такие как DeepPot-SE, дескрипторы на основе механизма внимания и гибридные дескрипторы, возможность подгонки тензильных свойств, встраивание типов (type embedding), оценка отклонения модели, коррекция DP-range, DP long range, поддержка GPU для настраиваемых операторов, сжатие моделей, молекулярная динамика вне фон-Неймана (non-von Neumann) и улучшенная удобство использования, включая документацию, скомпилированные бинарные пакеты, графические пользовательские интерфейсы и интерфейсы прикладного программирования. В статье приводится обзор текущей мажорной версии пакета DeePMD-kit с акцентом на его возможности и технические детали. Кроме того, представлена подробная процедура проведения молекулярной динамики в качестве репрезентативного применения, приведены бенчмарки точности и эффективности различных моделей и обсуждаются текущие направления разработки.
Key Findings
1
DeePMD-kit — это открытое программное обеспечение для молекулярной динамики с машинными потенциалами Deep Potential (DP), доступное с 2017 года.
2
Новые возможности включают подгонку тензильных свойств, оценку отклонения модели, DP-range correction и обработку дальнодействия DP (DP long range).
3
В статье представлен полный рабочий процесс MD, бенчмарки точности и эффективности разных DP-моделей и обсуждаются текущие направления развития.
4
Текущая основная версия добавляет множество продвинутых возможностей, включая DeepPot-SE, дескрипторы на основе внимания и гибридные дескрипторы, а также встраивание типов.
5
Пакет поддерживает ускорение на GPU для кастомных операторов, сжатие моделей и невон-Ноймановскую молекулярную динамику.
6
Улучшена удобство использования: расширенная документация, скомпилированные двоичные пакеты, графические интерфейсы и программные интерфейсы (API).
Research Object
Программный пакет DeePMD-kit для моделей Deep Potential (DP)
Research Subject
Функции, техническая реализация и производительность (точность и эффективность) DeePMD-kit для проведения молекулярной динамики с моделями Deep Potential, включая продвинутые дескрипторы, коррекции дальнодействия, поддержку GPU/пользовательских операторов, сжатие моделей, удобство использования и бенчмаркинг
Publication Details
Publication Date
2023-08-01
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
596
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest