Синтез и применение флуоресцентного нуклеозида, меченного 19F, в качестве двухрежимного зонда для i‑мотивов ДНК

Synthesis and application of a <sup>19</sup>F-labeled fluorescent nucleoside as a dual-mode probe for i-motif DNAs
Hiroshi Sugiyama, Ji Hye Yum, Soyoung Park, Wen Ann Wee, Shingo Hirashima
2021-01-01

19F-меченый флуоресцентный нуклеозиддвухрежимный зонд (флуоресценция и 19F ЯМР)i-мотив ДНКобратимое переключение флуоресценции (Ag(I) и цистеин)трифторометилфенилпирролоцитидин (FPdC)
Благодаря своей стабильной ориентации и минимальному вмешательству во взаимодействия и сворачивание нативной ДНК эмиссивные изоморфные нуклеозидные аналоги являются универсальными инструментами для точного анализа структурной неоднородности ДНК. В настоящей работе мы сообщаем о бифункциональном производном трифторометилфенилпирроло-цитидина (FPdC), которое проявляет беспрецедентный квантовый выход и высокочувствительный сигнал 19F ЯМР. Это первая публикация о цитозин-основанном зonde двойного назначения для флуоресцентного и 19F ЯМР-спектроскопического анализа ДНК. FPdC и ДНК, содержащие FPdC, были синтезированы и охарактеризованы; наш надёжный двойной зонд успешно использовали для исследования неконвенциональной структуры ДНК — i‑мотивов — через изменения интенсивности флуоресценции и химического сдвига 19F в ответ на формирование i‑мотива. Полезность FPdC проиллюстрирована обратимым переключением флуоресценции олигонуклеотида, содержащего FPdC, в присутствии Ag(I) и цистеина.
1
Синтезирован бифункциональный производный трифторметилфенилпирролоцитидин (FPdC) в качестве двухрежимного зонда, сочетающего флуоресценцию и чувствительность 19F NMR.
2
Олигонуклеотид с FPdC в i-мотиве демонстрировал обратимое переключение флуоресценции в ответ на Ag(I) и цистеин.
3
FPdC демонстрирует беспрецедентный квантовый выход и высокочувствительный 19F NMR сигнал среди цитоzин-базированных зондов.
4
ДНК, содержащая FPdC, успешно обнаруживала формирование i-мотива по изменениям интенсивности флуоресценции и химического сдвига 19F.
5
Это первая зарегистрированная цитоzин-базированная двуцелeвая молекула для одновременного флуоресцентного и 19F NMR спектроскопического анализа ДНК.

Производное трифторометилфенилпирроло-цитидина (FPdC) и олигонуклеотиды ДНК, содержащие FPdC, используемые в качестве двойного зондa (флуоресценция и 19F ЯМР)

Использование и характеристики FPdC как бифункционального зонда для детектирования и сигнальной репрезентации формирования i-мотивов ДНК посредством изменений интенсивности флуоресценции и 19F химического сдвига, включая обратимое переключение флуоресценции в ответ на Ag(I) и цистеин

Publication Details
Publication Date
2021-01-01
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
16
Access Type
Author Information
Authors
Hiroshi Sugiyama
Ji Hye Yum
Soyoung Park
Wen Ann Wee
Shingo Hirashima
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%