Современный алгоритм микробиологической диагностики антибиотико-ассоциированной диареи и псевдомембранозного колита, вызванных Clostridioides difficile
Modern algorуthm of microbiological diagnostics of antibiotic-associated diarrhea and pseudomembranous colitis due to Clostridioides difficile
2022-03-13
SCID: 54.1/d5wnnh9f
Discuss with AI
праймеры к 16S рРНК C. difficileClostridioides difficile-ассоциированная инфекция (C. difficile-associated infection)MALDI-TOF масс-спектрометрияПЦР риботипированиеэкзотоксины TcdA и TcdBантибиотик-ассоциированная диарея (AAD)асимптоматические носители C. difficileбинарный токсиниммуноферментный анализ (ELISA)детекция глутаматдегидрогеназы (GDG)псевдомембранозный колит (PMC)токсигенная культура и определение чувствительности к антибиотикамдвухэтапные и трехэтапные алгоритмы диагностики
Figures from the paper
Abstract (AI)
Введение. В настоящее время проблема ассоциированной с Clostridioides difficile инфекции (C. difficile-ассоциированная инфекция, C. difficile-AI) чаще всего проявляется двумя клиническими формами — антибиотико-ассоциированной диареей (AAD) и псевдомембранозным колитом (PMC), которые являются частыми побочными эффектами антибиотиков и варьируют от легкого до тяжелого течения. По данным авторов, AAD регистрируется у 3.2–29.0% пациентов, а риск развития PMC у оперированных пациентов составляет от 14 до 27%. Вопрос выявления и лечения C. difficile-AI особенно актуален в связи с возрастанием частоты регистрации AAD и PMC у пациентов с коронавирусной инфекцией (COVID-19), получавших большие дозы антибиотиков и блокаторы цитокинового шторма в ходе лечения. В современной зарубежной литературе AAD и PMC описываются как «нозокомиальный колит». Особую озабоченность вызывает категория пациентов — бессимптомные носители C. difficile, которые становятся эпидемиологически опасной группой, поддерживающей циркуляцию возбудителя в стационарах. Актуальность C. difficile-AI требует поиска эффективных методов и мероприятий лабораторной диагностики AAD и PMC, направленных на выявление и изучение биологических свойств возбудителей этих заболеваний. Материалы и методы. Для достижения поставленной цели проведен поиск литературы в англоязычной базе данных PubMed с использованием ключевых слов «C. difficile-associated infection», «antibiotic-associated diarrhea», «pseudomembranous colitis». Результаты и обсуждение. Основой алгоритмов исследования при диагностике C. difficile-AI является обнаружение фермента глутаматдегидрогеназы (GDH) с определением наличия экзотоксинов или генов, кодирующих GDH, TcdA, TcdB и бинарный токсин, а также бактериологическое исследование материала для выделения чистых культур возбудителя и изучения их биологических свойств. Американские и европейские общества микробиологов рекомендуют двухэтапный алгоритм, включающий скрининговый тест на выявление GDH в фекалиях и определение экзотоксинов (TcdA, TcdB) серологическими методами, такими как иммуноферментный анализ (ELISA) и иммунохроматографический анализ. При положительном результате ELISA или иммунохроматографического теста проводят бактериологическое исследование материала с последующим изучением токсигенных свойств и чувствительности выделенных штаммов C. difficile к антибиотикам. Наиболее оптимальным является трехэтапный алгоритм лабораторной диагностики C. difficile-AI, предусматривающий определение генов, кодирующих GDH, токсины A/B и бинарный токсин C. difficile. Отрицательный результат ПЦР позволяет прекратить дальнейший поиск возбудителя в образце, тогда как положительный результат (первый этап) требует бактериологического исследования образцов для выделения чистой культуры возбудителя (второй этап) и изучения ее чувствительности к антибиотикам (третий этап). Для повышения специфичности метода ПЦР предложен двухэтапный протокол с использованием праймеров к 16S-региону рРНК C. difficile, что позволило идентифицировать более 150 риботипов и 24 токсинотипа C. difficile. В качестве альтернативы ПЦР-риботипированию предложен метод масс-спектрометрии MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) для изучения эпидемических вспышек, профилирования бактерий и идентификации чистых культур C. difficile. MALDI-TOF и ПЦР-риботипирование могут быть использованы для мониторинга распространения возбудителя и проведения противоэпидемических мероприятий. Выводы. 1. В условиях неконтролируемого применения антибиотиков в лечебно-профилактических учреждениях заболеваемость C. difficile-AI имеет устойчивую тенденцию к росту. 2. Соблюдение определенного алгоритма диагностики C. difficile-AI необходимо для своевременного выявления AAD и PMC и предотвращения развития тяжелых форм. 3. Последовательная реализация этапов диагностики AAD и PMC предотвращает распространение нозокомиальных штаммов клостридий в стационаре.
Key Findings
1
Рекомендуемый диагностический алгоритм основан на выявлении глутаматдегидрогеназы (GDH) и детекции экзотоксинов (TcdA, TcdB) и/или их генов с последующей бактериологической культурой и фенотипированием.
2
Оптимальным считается трехэтапный лабораторный алгоритм: ПЦР на гены GDH/токсинов/бинарного токсина, культура для выделения C. difficile и тестирование чувствительности к антибиотикам.
3
Двухэтапная ПЦР с праймерами к 16S рРНК повышает специфичность и позволила идентифицировать более 150 риботипов и 24 токсинотипа C. difficile.
4
Антибиотико-ассоциированная диарея (ААД) регистрируется у 3,2–29,0% пациентов; риск псевдомембранозного колита (ПМК) у оперированных пациентов составляет 14–27%.
5
MALDI-TOF масс-спектрометрия и ПЦР-риботипирование эффективны для исследования вспышек и мониторинга внутрибольничного распространения C. difficile.
6
Строгое соблюдение диагностических алгоритмов и поэтапное тестирование способствует своевременному выявлению ААД/ПМК и предотвращению распространения внутрибольничных штаммов C. difficile на фоне роста заболеваемости.
Research Object
Лабораторный алгоритм диагностики инфекции, связанной с Clostridioides difficile (включая антибиотико‑ассоциированную диарею и псевдомембранозный колит)
Research Subject
Эффективность и состав многоэтапного микробиологического диагностического процесса (скрининг GDH, выявление токсинов методом ELISA/иммунохроматографии, ПЦР на гены GDH/токсинов, бактериологическая культура, ПЦР‑риботипирование и MALDI‑TOF‑типирование) для обнаружения, характеристики и руководства лечением/эпидконтролем инфекций C. difficile
Publication Details
Publication Date
2022-03-13
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
0
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest