Филодинамика вируса бешенства в Российской Федерации

Были определены почти полные последовательности N-гена вируса бешенства длиной 1 110 нт для 82 изолятов, полученных в различных регионах России в период с 2008 по 2016 год. Эти последовательности были проанализированы совместно со 108 репрезентативными последовательностями из базы данных GenBank за 1977–2016 годы с использованием байесовского коалесцентного подхода. Были оценены сроки основных эволюционных событий. Большинство изолятов относилось к степной группе вируса бешенства C, распространённой на обширной географической территории от Центральной России до Монголии и подразделявшейся на три группы (C0–C2) с различным географическим распространением. Один штамм степной линии вируса бешенства был выделен на Дальнем Востоке России (Приморский край), вероятно, в результате недавней антропогенной интродукции. Впервые полярная группа вируса бешенства A2, ранее описанная на Аляске, была выявлена в северной части европейской России и на Земле Франца-Иосифа. Филогенетический анализ показал, что все группы вируса бешенства, циркулирующие в настоящее время на территории Российской Федерации, были занесены в течение последних нескольких столетий, причём большинство групп распространилось в XX веке. Датировка эволюционных событий хорошо согласовывалась с историческими эпидемиологическими данными.