MetAlign 3.0: повышение производительности за счёт эффективного использования достижений компьютерного оборудования
MetAlign 3.0: performance enhancement by efficient use of advances in computer hardware
2011-10-07
SCID: 54.1/g5k4uq7v
Discuss with AI
ГХ-МС и ВЭЖХ-МСMetAlign 3.0производительность многоядерных системмногопоточная обработка данныхвыделение пиков
Figures from the paper
Abstract (AI)
Разработана новая многопоточная версия программного обеспечения MetAlign для обработки данных GC-MS и LC-MS, способная использовать несколько ядер одного ПК. Новая версия была протестирована на трёх различных многоядерных ПК с разными операционными системами. Подавление шума, коррекция базовой линии и выделение пиков выполнялись в 8–19 раз быстрее по сравнению с предыдущей версией на одноядерном компьютере 2008 года. Выравнивание выполнялось в 5–10 раз быстрее. Обсуждаются факторы, влияющие на повышение производительности. Наши наблюдения показывают, что производительность масштабируется с увеличением числа ядер процессора, наблюдаемым в настоящее время в развитии аппаратного обеспечения потребительских ПК.
Key Findings
1
Обработка выравнивания данных стала в 5–10 раз быстрее по сравнению с предыдущей версией.
2
MetAlign 3.0 внедряет многопоточную обработку данных GC-MS и LC-MS, используя несколько ядер процессора на одном компьютере.
3
Шумоподавление, коррекция базовой линии и выделение пиков выполнялись в 8–19 раз быстрее, чем в предыдущей однопоточной версии на компьютере 2008 года.
4
Наблюдаемое ускорение масштабировалось с увеличением числа ядер процессора в современных потребительских компьютерах.
5
Производительность оценивалась на трёх многоядерных компьютерах с разными операционными системами.
Research Object
Программное обеспечение MetAlign 3.0 для обработки данных GC-MS и LC-MS
Research Subject
Повышение производительности и масштабируемость шумоподавления, коррекции базовой линии, выделения пиков и выравнивания за счёт использования многоядерного аппаратного обеспечения
Publication Details
Publication Date
2011-10-07
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest