Ограничения отбора для адаптивных блужданий на коррелированных ландшафтах

Selection Limits to Adaptive Walks on Correlated Landscapes
Jorge Pérez Heredia, Barbora Trubenová, Dirk Sudholt, Tiago Paixão
2016-11-24

адаптивные блужданияаддитивные ландшафтыкоррелированные ландшафты приспособленностиэпистатические ландшафтырежим слабых мутаций
Адаптация в значительной степени зависит от эффектов новых мутаций и их зависимости от генетического фона, в котором они возникают. Эти два фактора можно обобщить с помощью ландшафта приспособленности. Однако определение и анализ ландшафтов приспособленности потребовали бы тестирования всех мутаций на всех генетических фонах, что делает такие исследования в основном недоступными. Вместо постулирования конкретного ландшафта приспособленности мы рассматриваем общие классы ландшафтов и вычисляем верхнюю границу времени, необходимого популяции для достижения пика приспособленности, тем самым устраняя необходимость в полном знании ландшафта приспособленности. Мы анализируем популяции в режиме слабой мутации и характеризуем условия, позволяющие им быстро достигать пика приспособленности, в зависимости от числа сайтов под действием отбора. Мы показываем, что для аддитивных ландшафтов существует критическая сила отбора, позволяющая популяциям достигать генотипов с высокой приспособленностью независимо от распределения эффектов мутаций. Этот порог масштабируется с числом сайтов под действием отбора, фактически устанавливая предел адаптации, и обусловлен неизбежным усилением давления вредных мутаций по мере адаптации популяции в пространстве дискретных генотипов. Кроме того, мы показываем, что для класса всех унимодальных ландшафтов это условие является достаточным, но не необходимым для быстрой адаптации, поскольку в некоторых высокоэпистатических ландшафтах критическая сила не зависит от числа сайтов под действием отбора, что фактически устраняет этот барьер адаптации.
1
Для всех унимодальных ландшафтов условие аддитивного случая достаточно, но не необходимо; сильный эпистаз может сделать критическую силу отбора независимой от числа отбираемых участков.
2
На аддитивных ландшафтах существует критическая сила отбора, позволяющая достигать генотипов с высокой приспособленностью независимо от распределения эффектов мутаций.
3
Для аддитивных ландшафтов критический порог отбора растёт с числом отбираемых участков, ограничивая адаптацию из-за неизбежного усиления давления вредных мутаций.
4
В режиме слабых мутаций быстрое адаптирование зависит от силы отбора и числа участков, находящихся под отбором.
5
Исследование выводит верхние границы времени достижения пиков приспособленности без задания полного фитнес-ландшафта.

Популяции, адаптирующиеся на коррелированных ландшафтах приспособленности в режиме слабых мутаций

Пределы и условия быстрого достижения пиков приспособленности в ходе адаптивных восхождений, включая зависимость критической силы отбора от числа отбираемых участков и влияние эпистаза

Publication Details
Publication Date
2016-11-24
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Jorge Pérez Heredia
Barbora Trubenová
Dirk Sudholt
Tiago Paixão
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%