Выявление невыявленных случаев семейной гиперхолестеринемии в системах здравоохранения с использованием машинного обучения
Finding missed cases of familial hypercholesterolemia in health systems using machine learning
2019-04-11
SCID: 54.1/h2vdwxab
Discuss with AI
электронные медицинские картысемейная гиперхолестеринемияскрининг с использованием машинного обученияположительная прогностическая ценностьклассификатор случайного леса
Figures from the paper
Abstract (AI)
Семейная гиперхолестеринемия (СГХС) представляет собой недодиагностированное доминантное генетическое заболевание, которым страдает примерно 0,4% населения; при отсутствии лечения оно связано с повышением риска ишемической болезни сердца до 20 раз. Простые стратегии скрининга характеризуются частотой ложноположительных результатов более 95%. В рамках инициативы FIND FH, реализуемой FH Foundation, мы разработали классификатор для выявления потенциальных пациентов с СГХС с использованием данных электронных медицинских карт (EHR) Stanford Health Care. Мы обучили классификатор на основе случайного леса с использованием данных известных пациентов (n = 197) и сопоставимых лиц без заболевания (n = 6590). На отложенной тестовой выборке классификатор продемонстрировал прогностическую ценность положительного результата (PPV) 0,88 и чувствительность 0,75. Точность прогнозов классификатора оценивали путем анализа медицинских карт 100 пациентов с риском СГХС, не включённых в исходный набор данных. При использовании порога наивысшей вероятности классификатор правильно выявил 84% пациентов; при снижении порога его эффективность уменьшалась. При внешней валидации на выборке из 466 пациентов с СГХС (236 с генетически подтверждённой СГХС) и 5000 сопоставимых лиц без заболевания из системы здравоохранения Geisinger классификатор СГХС достиг PPV 0,85. Классификатор СГХС, разработанный на основе данных EHR, эффективен для выявления пациентов-кандидатов для дальнейшего скрининга на СГХС. Такие стратегии, основанные на машинном обучении, могут обеспечить эффективное выявление пациентов с наиболее высоким риском, которым необходимы расширенные лечебно-профилактические мероприятия.
Key Findings
1
Разработан классификатор на основе случайного леса и данных электронных медицинских карт для выявления потенциальных пациентов с семейной гиперхолестеринемией.
2
При анализе медицинских карт классификатор правильно выявил 84% пациентов из группы риска при наиболее высоком пороге вероятности; при снижении порога эффективность уменьшалась.
3
При внешней валидации в системе Geisinger положительная прогностическая ценность составила 0,85 среди пациентов с семейной гиперхолестеринемией и сопоставимых лиц без заболевания.
4
Скрининг электронных медицинских карт с использованием машинного обучения может выявлять пациентов высокого риска для подтверждающего обследования на семейную гиперхолестеринемию и более интенсивного ведения.
5
На отложенной тестовой выборке Stanford классификатор достиг положительной прогностической ценности 0,88 и чувствительности 0,75.
Research Object
Пациенты с семейной гиперхолестеринемией или повышенным риском семейной гиперхолестеринемии, выявляемые по данным электронных медицинских карт
Research Subject
Выявление пропущенных случаев семейной гиперхолестеринемии с помощью машинного обучения на основе данных электронных медицинских карт, включая прогностическую эффективность классификатора и отбор кандидатов для дальнейшего скрининга
Publication Details
Publication Date
2019-04-11
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest