Статистический метод проверки нейтральной гипотезы мутаций по данным о полиморфизме ДНК

Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism.
Fumio Tajima
1989-11-01

полиморфизм ДНКDrosophila melanogasterнейтральная гипотеза мутацийнуклеотидные различиясегрегирующие сайты
Исследуется взаимосвязь между двумя оценками генетической изменчивости на уровне ДНК, а именно числом сегрегирующих сайтов и средним числом нуклеотидных различий, оцененным путем попарного сравнения. Установлено, что при небольшом объеме выборки корреляция между этими двумя оценками высока и медленно снижается с увеличением объема выборки. На основе полученной взаимосвязи разработан статистический метод проверки нейтральной гипотезы мутаций. Для этого метода необходимы только данные о полиморфизме ДНК, то есть данные о генетической изменчивости внутри популяции на уровне ДНК. Также представлен простой метод компьютерного моделирования, использованный для получения распределения разработанной новой статистики. Применение этого статистического метода к пяти участкам последовательностей ДНК Drosophila melanogaster показало, что крупные вставки/делеции (более 100 п. н.) вредны. Предполагается, что естественный отбор против крупных вставок/делеций настолько слаб, что в популяции сохраняется значительный объем изменчивости.
1
Предложен простой метод компьютерного моделирования для получения распределения нового статистического критерия.
2
Разработан статистический тест нейтральной мутационной гипотезы, использующий только данные о внутрипопуляционном полиморфизме ДНК.
3
Применение метода к пяти участкам ДНК Drosophila melanogaster показывает, что вставки или делеции размером более 100 пар оснований вредны.
4
Отбор против крупных вставок и делеций, по-видимому, настолько слаб, что в популяциях сохраняется значительная изменчивость.
5
Число сегрегирующих сайтов и среднее число попарных нуклеотидных различий сильно коррелируют при малых размерах выборки, причём корреляция медленно снижается с увеличением выборки.

Полиморфизм ДНК внутри популяций, включая сегрегирующие сайты и попарные различия нуклеотидов, с применением к последовательностям ДНК Drosophila melanogaster

Взаимосвязь оценок генетической вариабельности и статистическое выявление отклонений от нейтральной мутационной гипотезы, включая отбор против крупных вставок/делеций

Publication Details
Publication Date
1989-11-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Fumio Tajima
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%