Эпидемиология, генетическое разнообразие и первичная лекарственная устойчивость ВИЧ-1 в Тюменской области, Россия
HIV-1 Epidemiology, Genetic Diversity, and Primary Drug Resistance in the Tyumen Oblast, Russia
2016-01-01
SCID: 54.1/hcbe6x7b
Discuss with AI
тропизм к CXCR4рекомбинантные формы ВИЧ-1ВИЧ-1 подтип A1филогенетический анализпервичная лекарственная устойчивость
Figures from the paper
Abstract (AI)
Введение. Изучены специфические молекулярно-эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции в Тюменской области (ТО), Россия. Методы. Исследованы последовательности генома, кодирующие протеазу–обратную транскриптазу ВИЧ-1, интегразу и основной белок оболочки, у 72 образцов ВИЧ-1, выделенных от жителей ТО, инфицированных в 2000–2015 гг. Результаты. На долю подтипа A (A1) ВИЧ-1 приходилось 93,1% случаев; подтип B ВИЧ-1 продолжал циркулировать в группе риска мужчин, имеющих половые контакты с мужчинами (MSM) (1,4%). Выявлены единичные случаи рекомбинантных форм ВИЧ-1 CRF63_02A1 (1,4%) и CRF03_AB (1,4%), а также два случая ВИЧ-1 URF63_A1 (2,8%). Филогенетический анализ не выявил кластеризации ВИЧ-1 в зависимости от длительности инфекции или принадлежности к группе риска, однако обнаружил различные эпидемические сети, что подтверждает распространение ВИЧ-инфекции в пределах локальных эпидемических очагов. Среди образцов, выделенных от недавно инфицированных лиц, наблюдались высокая частота CXCR4-тропных вариантов ВИЧ-1 и повышенная частота вторичных мутаций, влияющих на приспособленность вируса (K20R, L10V и I). Заключение. Современная эпидемия ВИЧ-1 в ТО развивается в пределах локальных эпидемических сетей. Как и в предыдущий период, в ТО преобладает подтип A ВИЧ-1; при этом спорадически выявляются завозные рекомбинантные формы ВИЧ-1, циркулирующие в соседних регионах.
Key Findings
1
В Тюменской области преобладал ВИЧ-1 подтипа A (A1), составивший 93,1% исследованных образцов 2000–2015 годов.
2
У недавно инфицированных лиц часто выявлялись варианты ВИЧ-1 с тропизмом к CXCR4 и повышенная частота вторичных мутаций, связанных с приспособленностью вируса, включая K20R, L10V и I.
3
Филогенетический анализ выявил отдельные эпидемические сети без кластеризации по длительности инфекции или группам риска, что указывает на передачу в локальных очагах.
4
Подтип B сохранялся спорадически среди мужчин, имеющих секс с мужчинами, тогда как рекомбинантные формы CRF63_02A1, CRF03_AB и URF63_A1 встречались редко.
5
Эпидемия ВИЧ-1 в Тюменской области преимущественно развивалась в локальных сетях, при спорадическом заносе рекомбинантных форм из соседних регионов.
Research Object
ВИЧ-1-инфекция и циркулирующие вирусные образцы у жителей Тюменской области России
Research Subject
Молекулярно-эпидемиологические характеристики, генетическое разнообразие, сети передачи, тропизм и мутации ВИЧ-1, ассоциированные с первичной лекарственной устойчивостью
Publication Details
Publication Date
2016-01-01
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest