Эпидемиология, генетическое разнообразие и первичная лекарственная устойчивость ВИЧ-1 в Тюменской области, Россия

HIV-1 Epidemiology, Genetic Diversity, and Primary Drug Resistance in the Tyumen Oblast, Russia
Н. М. Гашникова, Ekaterina M. Astakhova, Mariya P. Gashnikova, E. F. Bocharov, Světlana Petrová, Olga A. Pun’ko, A. V. Popkov, А. В. Тотменин
2016-01-01

тропизм к CXCR4рекомбинантные формы ВИЧ-1ВИЧ-1 подтип A1филогенетический анализпервичная лекарственная устойчивость
Введение. Изучены специфические молекулярно-эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции в Тюменской области (ТО), Россия. Методы. Исследованы последовательности генома, кодирующие протеазу–обратную транскриптазу ВИЧ-1, интегразу и основной белок оболочки, у 72 образцов ВИЧ-1, выделенных от жителей ТО, инфицированных в 2000–2015 гг. Результаты. На долю подтипа A (A1) ВИЧ-1 приходилось 93,1% случаев; подтип B ВИЧ-1 продолжал циркулировать в группе риска мужчин, имеющих половые контакты с мужчинами (MSM) (1,4%). Выявлены единичные случаи рекомбинантных форм ВИЧ-1 CRF63_02A1 (1,4%) и CRF03_AB (1,4%), а также два случая ВИЧ-1 URF63_A1 (2,8%). Филогенетический анализ не выявил кластеризации ВИЧ-1 в зависимости от длительности инфекции или принадлежности к группе риска, однако обнаружил различные эпидемические сети, что подтверждает распространение ВИЧ-инфекции в пределах локальных эпидемических очагов. Среди образцов, выделенных от недавно инфицированных лиц, наблюдались высокая частота CXCR4-тропных вариантов ВИЧ-1 и повышенная частота вторичных мутаций, влияющих на приспособленность вируса (K20R, L10V и I). Заключение. Современная эпидемия ВИЧ-1 в ТО развивается в пределах локальных эпидемических сетей. Как и в предыдущий период, в ТО преобладает подтип A ВИЧ-1; при этом спорадически выявляются завозные рекомбинантные формы ВИЧ-1, циркулирующие в соседних регионах.
1
В Тюменской области преобладал ВИЧ-1 подтипа A (A1), составивший 93,1% исследованных образцов 2000–2015 годов.
2
У недавно инфицированных лиц часто выявлялись варианты ВИЧ-1 с тропизмом к CXCR4 и повышенная частота вторичных мутаций, связанных с приспособленностью вируса, включая K20R, L10V и I.
3
Филогенетический анализ выявил отдельные эпидемические сети без кластеризации по длительности инфекции или группам риска, что указывает на передачу в локальных очагах.
4
Подтип B сохранялся спорадически среди мужчин, имеющих секс с мужчинами, тогда как рекомбинантные формы CRF63_02A1, CRF03_AB и URF63_A1 встречались редко.
5
Эпидемия ВИЧ-1 в Тюменской области преимущественно развивалась в локальных сетях, при спорадическом заносе рекомбинантных форм из соседних регионов.

ВИЧ-1-инфекция и циркулирующие вирусные образцы у жителей Тюменской области России

Молекулярно-эпидемиологические характеристики, генетическое разнообразие, сети передачи, тропизм и мутации ВИЧ-1, ассоциированные с первичной лекарственной устойчивостью

Publication Details
Publication Date
2016-01-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Н. М. Гашникова
Ekaterina M. Astakhova
Mariya P. Gashnikova
E. F. Bocharov
Světlana Petrová
Olga A. Pun’ko
A. V. Popkov
А. В. Тотменин
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%