Картирование генетической архитектуры COVID-19 у человека

Mapping the human genetic architecture of COVID-19
COVID-19 Host Genetics Initiative, COVID-19 Host Genetics InitiativeLeadership, Mari Niemi, Juha Karjalainen, Rachel G. Liao, Benjamin M. Neale, Mark J. Daly, Andrea Ganna, Writing group, Writing group leaders, Gita A. Pathak, Shea J. Andrews, Masahiro Kanai, Writing group members, Kumar Veerapen, Israel Fernández‐Cadenas, Eva C. Schulte, Pasquale Striano, M. Marttila, Camelia C. Minică, Eirini Marouli, Mohd Anisul Karim, Frank R. Wendt, Jeanne E. Savage, Laura Sloofman, Guillaume Butler‐Laporte, Han‐Na Kim, Stavroula Kanoni, Yukinori Okada, Jinyoung Byun, Younghun Han, Mohammed Jashim Uddin, George Davey Smith, Cristen J. Willer, Joseph D. Buxbaum, Analysis group, Manuscript analyses team leader, Manuscript analyses team member: meta-analysis, Juha Mehtonen, Manuscript analyses team member: heritability, methods and supplements, Manuscript analyses team member: PHEWAS, Manuscript analyses team member: Mendelian randomization, Manuscript analyses team member: PC projection and gene prioritization, Manuscript analyses team member: gene prioritization, Hilary K. Finucane, Manuscript analyses team member: sensitivity analysis, Mattia Cordioli, Manuscript analyses team members: PC projection, Alicia R. Martin, Wei Zhou, In silico analysis team members, Bogdan Paşaniuc, Hanna Julienne, Hugues Aschard, Huwenbo Shi, Loïc Yengo, Renato Polimanti, Maya Ghoussaini, Jeremy Schwartzentruber, Ian Dunham, Project management group, Project management leader, Project management support, Karolina Chwiałkowska, Margherita Francescatto, Amy Trankiem, Mary K. Balaconis, Phenotype steering group, Lea K. Davis, Sulggi A. Lee, James R. Priest, Alessandra Renieri, Vijay G. Sankaran, David A. van Heel, Patrick Deelen, J. Brent Richards, Tomoko Nakanishi, Les Biesecker, V. Eric Kerchberger, J. Kenneth Baillie, Data dictionary, Francesca Mari, Anna Bernasconi, Arif Canakoglu, Scientific communication group, Scientific communication leaders, Brooke Wolford, Scientific communication members, Annika Faucon, Atanu Kumar Dutta, Claudia Schurmann, Emi N. Harry, Ewan Birney, Huy Nguyen, Jamal Nasir, Mari Kaunisto, Matthew Solomonson, Nicole Dueker, Nirmal Vadgama
2021-07-08

генетика хозяина COVID-19менделевская рандомизациявосприимчивость к инфекции SARS-CoV-2метаанализ полногеномных ассоциативных исследованийгенетическая архитектура человека
Генетический состав человека влияет на восприимчивость к вирусной инфекции и реакцию на неё. Хотя факторы окружающей среды, клинические и социальные факторы влияют на вероятность контакта с SARS-CoV-2 и тяжесть COVID-19 1,2, генетика хозяина также может иметь значение. Выявление генетических факторов, специфичных для хозяина, может раскрыть биологические механизмы, имеющие терапевтическое значение, и прояснить причинно-следственные связи модифицируемых факторов риска окружающей среды для инфицирования SARS-CoV-2 и исходов заболевания. Мы сформировали глобальную сеть исследователей для изучения роли генетики человека в инфицировании SARS-CoV-2 и тяжести COVID-19. Здесь мы описываем результаты трёх метаанализов полногеномных ассоциативных исследований, включавших до 49 562 пациентов с COVID-19 из 46 исследований, проведённых в 19 странах. Мы выявили 13 локусов, достигших полногеномного уровня статистической значимости и ассоциированных с инфицированием SARS-CoV-2 или тяжёлыми проявлениями COVID-19. Несколько из этих локусов соответствуют ранее описанным ассоциациям с заболеваниями лёгких, аутоиммунными и воспалительными заболеваниями 3–7. Они также представляют потенциально поддающиеся воздействию механизмы ответа на инфекцию. Анализы менделевской рандомизации подтверждают причинную роль курения и индекса массы тела в развитии тяжёлого COVID-19, но не сахарного диабета 2-го типа. Выявление новых генетических факторов хозяина, ассоциированных с COVID-19, стало возможным благодаря объединению сообщества исследователей в области генетики человека для приоритетного обмена данными, результатами, ресурсами и аналитическими методологиями. Эта модель международного сотрудничества подчёркивает возможности будущих генетических открытий при возникающих пандемиях и, в частности, при любом сложном заболевании человека.
1
Глобальный консорциум провёл три метаанализа полногеномных ассоциаций, включивших до 49 562 пациентов с COVID-19 из 46 исследований в 19 странах.
2
Международный обмен данными и ресурсами сделал возможным выявление генетических факторов хозяина и предложил модель сотрудничества для исследований будущих пандемий.
3
Менделевская рандомизация подтвердила причинную роль курения и индекса массы тела в развитии тяжёлого COVID-19, но не сахарного диабета 2-го типа.
4
Несколько связанных локусов совпадают с ранее описанными генетическими ассоциациями с заболеваниями лёгких, аутоиммунными и воспалительными заболеваниями, указывая на потенциально терапевтически значимые механизмы.
5
Анализ выявил 13 локусов, достигших полногеномной значимости и связанных с заражением SARS-CoV-2 или тяжёлыми проявлениями COVID-19.

Генетическая архитектура человека, лежащая в основе восприимчивости к инфекции SARS-CoV-2 и тяжести COVID-19

Генетические факторы хозяина, ассоциированные локусы и причинно-следственные связи, влияющие на инфекцию SARS-CoV-2 и тяжёлые исходы COVID-19

Publication Details
Publication Date
2021-07-08
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
1130
Access Type
Author Information
Authors
COVID-19 Host Genetics Initiative
COVID-19 Host Genetics InitiativeLeadership
Mari Niemi
Juha Karjalainen
Rachel G. Liao
Benjamin M. Neale
Mark J. Daly
Andrea Ganna
Writing group
Writing group leaders
Gita A. Pathak
Shea J. Andrews
Masahiro Kanai
Writing group members
Kumar Veerapen
Israel Fernández‐Cadenas
Eva C. Schulte
Pasquale Striano
M. Marttila
Camelia C. Minică
Eirini Marouli
Mohd Anisul Karim
Frank R. Wendt
Jeanne E. Savage
Laura Sloofman
Guillaume Butler‐Laporte
Han‐Na Kim
Stavroula Kanoni
Yukinori Okada
Jinyoung Byun
Younghun Han
Mohammed Jashim Uddin
George Davey Smith
Cristen J. Willer
Joseph D. Buxbaum
Analysis group
Manuscript analyses team leader
Manuscript analyses team member: meta-analysis
Juha Mehtonen
Manuscript analyses team member: heritability, methods and supplements
Manuscript analyses team member: PHEWAS
Manuscript analyses team member: Mendelian randomization
Manuscript analyses team member: PC projection and gene prioritization
Manuscript analyses team member: gene prioritization
Hilary K. Finucane
Manuscript analyses team member: sensitivity analysis
Mattia Cordioli
Manuscript analyses team members: PC projection
Alicia R. Martin
Wei Zhou
In silico analysis team members
Bogdan Paşaniuc
Hanna Julienne
Hugues Aschard
Huwenbo Shi
Loïc Yengo
Renato Polimanti
Maya Ghoussaini
Jeremy Schwartzentruber
Ian Dunham
Project management group
Project management leader
Project management support
Karolina Chwiałkowska
Margherita Francescatto
Amy Trankiem
Mary K. Balaconis
Phenotype steering group
Lea K. Davis
Sulggi A. Lee
James R. Priest
Alessandra Renieri
Vijay G. Sankaran
David A. van Heel
Patrick Deelen
J. Brent Richards
Tomoko Nakanishi
Les Biesecker
V. Eric Kerchberger
J. Kenneth Baillie
Data dictionary
Francesca Mari
Anna Bernasconi
Arif Canakoglu
Scientific communication group
Scientific communication leaders
Brooke Wolford
Scientific communication members
Annika Faucon
Atanu Kumar Dutta
Claudia Schurmann
Emi N. Harry
Ewan Birney
Huy Nguyen
Jamal Nasir
Mari Kaunisto
Matthew Solomonson
Nicole Dueker
Nirmal Vadgama
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%