Количественный анализ эмпирических ландшафтов приспособленности

Quantitative analyses of empirical fitness landscapes
Ivan G Szendro, Martijn F Schenk, Jasper Franke, Joachim Krug, J Arjan G M de Visser
2013-01-16

эмпирические ландшафтымеры эпистазаландшафты приспособленностишероховатость ландшафташероховатая модель Маунт-Фудзи
Концепция ландшафта приспособленности представляет собой мощную метафору, позволяющую понять различные аспекты эволюционных процессов и служащую ориентиром для изучения эволюции. До недавнего времени эмпирические данные о степени изрезанности этих ландшафтов отсутствовали, однако после того, как стало возможным конструировать все возможные генотипы, содержащие комбинации ограниченного набора мутаций, число исследований возросло настолько, что классификация ландшафтов стала возможной. Цель данного обзора — выявить меры эпистаза, позволяющие осмысленно сравнивать ландшафты приспособленности, а затем применить их к эмпирическим ландшафтам, чтобы определить факторы, влияющие на их изрезанность. Различные меры эпистаза, предложенные в научной литературе, по-видимому, эквивалентны. Наше сравнение показывает, что изрезанность эмпирического ландшафта зависит от того, являются ли включённые мутации благоприятными или вредными, а также от того, имеет ли место внутригенный или межгенный эпистаз. Наконец, эмпирические ландшафты сравниваются с ландшафтами, сгенерированными с использованием модели шероховатой горы Фудзи. Несмотря на простоту этой модели, она Remarkably хорошо воспроизводит особенности экспериментальных ландшафтов.
1
Различные предложенные в литературе меры эпистаза, по-видимому, эквивалентны для характеристики изрезанности ландшафта.
2
Изрезанность эмпирического ландшафта зависит от того, являются ли включённые мутации благоприятными или вредными.
3
Изрезанность различается в зависимости от того, происходит ли эпистаз внутри генов или между генами.
4
В обзоре выявлены меры эпистаза, позволяющие содержательно сравнивать эмпирические ландшафты приспособленности.
5
Несмотря на простоту, модель шероховатой горы Фудзи воспроизводит ключевые особенности экспериментальных ландшафтов приспособленности.

эмпирические ландшафты приспособленности, заданные комбинациями ограниченного набора мутаций

шероховатость ландшафта и её зависимость от эффектов мутаций, а также от внутригенной и межгенной эпистазии

Publication Details
Publication Date
2013-01-16
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Ivan G Szendro
Martijn F Schenk
Jasper Franke
Joachim Krug
J Arjan G M de Visser
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%