ДНК-штрихкодирование: частота ошибок при комплексном отборе образцов

ДНК-штрихкодирование привлекло внимание благодаря перспективе содействовать идентификации и обнаружению видов; однако для оценки его эффективности доступно лишь небольшое число наборов данных с полноценным отбором образцов. Мы впервые исследуем эффективность штрихкодирования на репрезентативно и всесторонне отобранной разнообразной группе — морских брюхоногих моллюсках семейства Cypraeidae, или каури. Мы используем ранее разработанные методы оценки эффективности и применяем новый филогенетический подход для расчёта внутривидовой изменчивости и межвидовой дивергенции. Частоту ошибок оценивают для (1) идентификации образцов относительно хорошо охарактеризованной филогении и (2) содействия обнаружению видов в частично изученных группах. Мы обнаружили, что минимальная общая частота ошибок при идентификации видов составляет 4%. Напротив, в группах с неполным отбором образцов штрихкодирование работает неудовлетворительно. В этом случае разграничение видов основывается на использовании пороговых значений, предназначенных для дифференциации внутривидовой изменчивости и межвидовой дивергенции. Хотя сторонники метода предполагают существование «штрихкодингового разрыва» между ними, мы обнаружили значительное перекрывание, приводящее к минимальной частоте ошибок приблизительно 17% у каури. Более того, частота ошибок удваивается, если анализировать только традиционно признанные виды. Таким образом, ДНК-штрихкодирование перспективно для идентификации в таксономически хорошо изученных и тщательно отобранных кладах. Однако использование пороговых значений не способствует разграничению близкородственных видов в таксономически недостаточно изученных группах. Потенциал штрихкодирования будет реализован только при наличии прочной таксономической основы.