Разработка маркеров KASP для анализа засухоустойчивости сои на стадии прорастания на основе GWAS

Development of KASP markers assisted with soybean drought tolerance in the germination stage based on GWAS
Hongmei Zhang, Qiong Wang, Junyan Wang, Qianru Jia, Miaomiao Zhou, Yawen Xiong, Donghe Xu, Xiaoqing Liu, Wei Zhang, Xin Sun, Huatao Chen
2024-02-15

GWAS (геномные ассоциативные исследования)KASP-маркерыстадия прорастаниямаркерные SNP с высокой плотностьюзасуха сои
Соя (Glycine max (L.) Merr.) является ведущей масличной культурой, возделываемой во всем мире. Сельское хозяйство в Китае сталкивается с серьезной проблемой засухи, существенно снижающей урожай сои. В данном исследовании естественную популяцию из 264 китайских образцов сои обрабатывали 15% PEG-6000, а в качестве оценочных показателей использовали скорость прорастания (GR), энергию прорастания (GE), индекс прорастания (GI), относительную скорость прорастания (RGR), относительную энергию прорастания (RGE), относительный индекс прорастания (RGI) и совокупную биологическую силу сеянцев (ASFV). С помощью ASFV было отобрано 17 образцов сои с высокой засухоустойчивостью на стадии прорастания. С использованием 2 597 425 высокоплотных маркеров однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) проведено исследование ассоциаций по всему геному (GWAS), в результате которого выявлено 92 SNP и 9 кандидатов-генов, значимо связанных с засухоустойчивостью. Кроме того, разработаны два маркера KASP для S14_5147797 и S18_53902767, тесно связанных с засухоустойчивостью. Данное исследование пополняет пул генетического материала сои и закладывает прочную основу для молекулярной селекции засухоустойчивых сортов сои.
1
GWAS с использованием 2 597 425 высокоплотных SNP выявил 92 SNP, статистически связанных с устойчивостью к засухе.
2
По результатам GWAS идентифицированы девять кандидатных генов, связанных с устойчивостью к засухе на стадии прорастания.
3
Обработка 264 китайских сортов сои 15% PEG-6000 и использование показателей GR, GE, GI, RGR, RGE, RGI и ASFV позволили отобрать устойчивость к засухе на стадии прорастания.
4
Разработаны два KASP-маркера (для S14_5147797 и S18_53902767), тесно связанных с устойчивостью к засухе, что облегчает молекулярное селекционирование.
5
По показателю ASFV выявлено 17 сортов сои с высокой устойчивостью к засухе на стадии прорастания.

Популяция китайских сортотипов сои (264 образца) на стадии прорастания при стрессовом засушливом воздействии, вызванном 15% PEG-6000

Выявление SNP и кандидатных генов и разработка KASP-маркеров, ассоциированных с устойчивостью к засухе на стадии прорастания, с помощью GWAS и физиологических индексов (GR, GE, GI, RGR, RGE, RGI, ASFV)

Publication Details
Publication Date
2024-02-15
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
26
Access Type
Author Information
Authors
Hongmei Zhang
Qiong Wang
Junyan Wang
Qianru Jia
Miaomiao Zhou
Yawen Xiong
Donghe Xu
Xiaoqing Liu
Wei Zhang
Xin Sun
Huatao Chen
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%