Разработка маркеров KASP для анализа засухоустойчивости сои на стадии прорастания на основе GWAS
Development of KASP markers assisted with soybean drought tolerance in the germination stage based on GWAS
2024-02-15
SCID: 54.1/k2yc2qyf
Discuss with AI
GWAS (геномные ассоциативные исследования)KASP-маркерыстадия прорастаниямаркерные SNP с высокой плотностьюзасуха сои
Figures from the paper
Abstract (AI)
Соя (Glycine max (L.) Merr.) является ведущей масличной культурой, возделываемой во всем мире. Сельское хозяйство в Китае сталкивается с серьезной проблемой засухи, существенно снижающей урожай сои. В данном исследовании естественную популяцию из 264 китайских образцов сои обрабатывали 15% PEG-6000, а в качестве оценочных показателей использовали скорость прорастания (GR), энергию прорастания (GE), индекс прорастания (GI), относительную скорость прорастания (RGR), относительную энергию прорастания (RGE), относительный индекс прорастания (RGI) и совокупную биологическую силу сеянцев (ASFV). С помощью ASFV было отобрано 17 образцов сои с высокой засухоустойчивостью на стадии прорастания. С использованием 2 597 425 высокоплотных маркеров однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) проведено исследование ассоциаций по всему геному (GWAS), в результате которого выявлено 92 SNP и 9 кандидатов-генов, значимо связанных с засухоустойчивостью. Кроме того, разработаны два маркера KASP для S14_5147797 и S18_53902767, тесно связанных с засухоустойчивостью. Данное исследование пополняет пул генетического материала сои и закладывает прочную основу для молекулярной селекции засухоустойчивых сортов сои.
Key Findings
1
GWAS с использованием 2 597 425 высокоплотных SNP выявил 92 SNP, статистически связанных с устойчивостью к засухе.
2
По результатам GWAS идентифицированы девять кандидатных генов, связанных с устойчивостью к засухе на стадии прорастания.
3
Обработка 264 китайских сортов сои 15% PEG-6000 и использование показателей GR, GE, GI, RGR, RGE, RGI и ASFV позволили отобрать устойчивость к засухе на стадии прорастания.
4
Разработаны два KASP-маркера (для S14_5147797 и S18_53902767), тесно связанных с устойчивостью к засухе, что облегчает молекулярное селекционирование.
5
По показателю ASFV выявлено 17 сортов сои с высокой устойчивостью к засухе на стадии прорастания.
Research Object
Популяция китайских сортотипов сои (264 образца) на стадии прорастания при стрессовом засушливом воздействии, вызванном 15% PEG-6000
Research Subject
Выявление SNP и кандидатных генов и разработка KASP-маркеров, ассоциированных с устойчивостью к засухе на стадии прорастания, с помощью GWAS и физиологических индексов (GR, GE, GI, RGR, RGE, RGI, ASFV)
Publication Details
Publication Date
2024-02-15
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
26
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest