phytools: пакет R для сравнительной филогенетики (и других задач)

1. В данной работе представлен новый многофункциональный пакет для филогенетики phytools, предназначенный для статистической вычислительной среды R. 2. Основное внимание в пакете уделено методам сравнительной филогенетики; однако он также включает инструменты для реконструкции деревьев, ввода и вывода филогенетических данных, построения графиков, манипуляций с данными и выполнения ряда других задач. 3. Описаны и сведены в таблицу основные методы, реализованные в phytools; кроме того, приведены два иллюстративных примера использования пакета. 4. В заключение кратко описан действующий веб-блог, который используется для документирования текущих и будущих разработок phytools. Также упомянуты другие веб-ресурсы, посвящённые филогенетике в вычислительной среде R.