Анализ экспрессии генов в трех когортах пациентов с посттравматическим стрессовым расстройством указывает на вовлеченность путей воспаления и врожденного иммунитета и выявляет общий генетический риск с большим депрессивным расстройством

Посттравматическое стрессовое расстройство (ПТСР) представляет собой сложное психическое расстройство, которое может развиться после воздействия травмирующих событий. Группа по изучению ПТСР Консорциума психиатрической геномики (PGC-PTSD) собрала более 20 000 случаев ПТСР и контрольных участников из разных этнических групп и выявила генетические и эпигенетические факторы, ассоциированные с риском ПТСР. Для дальнейшего изучения биологических коррелятов риска ПТСР мы исследовали три когорты PGC-PTSD, включавшие 977 участников, чтобы выявить дифференциально экспрессируемые гены у пациентов с ПТСР и контрольных участников. Экспрессию генов в цельной крови количественно оценивали с помощью микрочипа HumanHT-12 v4 Expression BeadChip у 726 ветеранов операций OEF/OIF из Центра исследований, образования и клинической помощи по психическим заболеваниям (MIRECC) Управления по делам ветеранов (VA), 155 образцов из Клинического консорциума по изучению травм и травматического стресса (INTRuST) и 96 австралийских ветеранов войны во Вьетнаме. Анализ дифференциальной экспрессии генов проводили отдельно в каждой когорте, после чего выполняли метаанализ. В крупнейшей когорте мы провели анализ коэкспрессии для выявления модулей генов, ассоциированных с ПТСР и большим депрессивным расстройством (БДР). Затем был выполнен анализ локусов количественных признаков экспрессии (eQTL) и оценено наличие взаимодействий eQTL, связанных с ПТСР и большим депрессивным расстройством (БДР). Наконец, с использованием сводной статистики полногеномных исследований ассоциаций (GWAS) для ПТСР и БДР были выявлены области, колокализованные с eQTL. Хотя после поправки на множественное тестирование эти результаты не достигли статистической значимости, наиболее дифференциально экспрессируемыми генами в метаанализе были интерлейкин-1 бета (IL1B) — провоспалительный цитокин, ранее ассоциированный с ПТСР, — и киназа, связанная с интегринами (ILK), которая высоко экспрессируется в головном мозге и может восстанавливать нарушенные нейрогенез гиппокампа и дефицит памяти. Анализ путей выявил обогащение генами толл-подобных рецепторов (TLR) и рецепторов интерлейкина-1, играющими ключевую роль во врожденном иммунном ответе клеток. Анализ коэкспрессии выявил четыре модуля генов, ассоциированных с ПТСР; два из них также ассоциированы с БДР, что демонстрирует общ...