Эпидемиология туберкулёза и отбор в автохтонной сибирской популяции с XVI по XIX век

Туберкулёз — одно из древнейших заболеваний, поражающих человеческие популяции. Несмотря на многочисленные попытки обнаружить ДНК патогенов в древних скелетах, успешная идентификация древних штаммов туберкулёза по-прежнему встречается редко. В настоящей работе описано исследование 140 древних индивидов, захороненных в Якутии, в Восточной Сибири, во время вспышки туберкулёза, датируемой XVI–XIX веками. На протяжении длительного времени якутские популяции оставались изолированными от европейских популяций, и только в начале XVII века состоялись первые контакты с европейскими поселенцами. Впоследствии туберкулёз распространился по всей Якутии, а изменения частоты туберкулёза можно проследить вплоть до XIX века. В исследовании применён междисциплинарный подход: исторические и палеоэпидемиологические данные изучались для понимания влияния туберкулёза на древнюю якутскую популяцию. Кроме того, была проведена молекулярная идентификация древнего штамма туберкулёза для выяснения естественной истории туберкулёза человека и коэволюции хозяина и патогена, представленных в этой популяции. Для этого осуществляли молекулярное выявление последовательности IS6110 и генотипирование однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) методом SNaPshot. Результаты показали, что штамм относится к кластеру PGG2-SCG-5, что указывает на его европейское происхождение. Полученные данные свидетельствуют о том, что якутская популяция могла формироваться под воздействием отбора, обусловленного несколькими заболеваниями, включая туберкулёз, на протяжении нескольких столетий. Это подтверждает обоснованность и необходимость применения междисциплинарного подхода для изучения естественной истории инфекции и заболевания, вызываемых Mycobacterium tuberculosis.