Филогенетический анализ вируса инфекционного перитонита кошек, кишечного коронавируса кошек и коронавируса 2 тяжёлого острого респираторного синдрома у кошек в Сурабае, Индонезия

Обоснование и цель: Вопросы о происхождении коронавируса и его передаче человеку остаются актуальными. Обнаружение у летучих мышей и панголинов различных коронавирусов, родственных коронавирусу 2 тяжёлого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2), привело к широкому распространению представления о том, что SARS-CoV-2 произошёл от диких животных и был передан человеку через промежуточного хозяина. Поэтому коронавирусы животных, особенно находящихся в тесном контакте с человеком, привлекают особое внимание. Целью настоящего исследования был филогенетический анализ кишечного коронавируса кошек (FECV), вируса инфекционного перитонита кошек (FIPV) и SARS-CoV-2, обнаруженных у кошек в Сурабае в период пандемии COVID-19. Полученные результаты послужат основой для разработки базовых стратегий профилактики и ветеринарного ухода за домашними животными. Материалы и методы: Образцы собирали во время физикального обследования домашних и персидских кошек (самцов и самок) с марта 2020 года по март 2022 года. Образцы отбирали при наличии клинических признаков FECV и инфекционного перитонита кошек (FIP), установленных ветеринарным врачом в нескольких клиниках Сурабаи. Лабораторные исследования выполняли методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) с использованием праймеров к консервативным участкам FIPV и FECV; секвенирование ДНК проводили по протоколу Applied Biosystems Genetic Analyzer; анализ гомологии выполняли с использованием инструмента Basic Local Alignment Search Tool Национального центра биотехнологической информации (NCBI); филогенетический анализ проводили в программе BioEdit 7.2; последовательности сравнивали с референсными последовательностями из GenBank. Результаты: Образцы были получены от десяти кошек с клиническими признаками FECV и FIP, установленными ветеринарным врачом. При ОТ-ПЦР, выполненной с использованием специально разработанных праймеров для выявления FIPV в крови, перитонеальной жидкости и фекалиях, положительным на FIPV оказался только один образец (1/10), а именно перитонеальный образец от домашней кошки из Сурабаи. Анализ гомологии изолята FIPV из Сурабаи показал 98% сходства с FECV и FIPV, описанными в GenBank (...