Mordred: калькулятор молекулярных дескрипторов

Молекулярные дескрипторы широко используются для представления молекулярных характеристик в химоинформатике. Было разработано множество программ для вычисления молекулярных дескрипторов, однако пользователям таких программ приходится сталкиваться с рядом проблем, включая ошибки в программном обеспечении, редкие обновления и ограничения лицензионных условий. Для решения этих проблем мы предлагаем Mordred — программу для вычисления дескрипторов, способную вычислять более 1800 двумерных и трехмерных дескрипторов. Программа свободно доступна на GitHub. Mordred легко устанавливается и может использоваться через командную строку, в качестве веб-приложения или как высокоадаптируемый пакет для Python на всех основных платформах (Windows, Linux и macOS). Результаты тестов производительности показывают, что Mordred как минимум в два раза быстрее широко известного PaDEL-Descriptor и может рассчитывать дескрипторы для крупных молекул, с чем не справляются другие программы. Благодаря высокой производительности, удобству, большому набору дескрипторов и мягким лицензионным ограничениям Mordred является перспективным выбором программного обеспечения для расчета молекулярных дескрипторов, применяемого в исследованиях химоинформатики, таких как анализы «количество структуры — свойство» (quantitative structure–property relationships).