SWISS-MODEL и Swiss-Pdb Viewer: среда для сравнительного моделирования белков

Сравнительное моделирование белков приобретает все большее значение, поскольку оно существенно помогает при рациональном планировании экспериментов по мутагенезу. Однако доступность этого метода и получаемых с его помощью моделей была ограничена необходимостью использования дорогостоящих аппаратных и программных средств. Для преодоления этих ограничений мы разработали среду для сравнительного моделирования белков, включающую SWISS-MODEL — сервер автоматизированного сравнительного моделирования белков — и Swiss-PdbViewer — рабочую среду для перехода от последовательности к структуре. Swiss-PdbViewer не только выполняет функции клиента SWISS-MODEL, но и предоставляет широкий набор инструментов для анализа и визуализации структур. Кроме того, мы предлагаем SWISS-MODEL Repository — базу данных, содержащую более 3500 автоматически сгенерированных моделей белков. Предоставляя такие инструменты научному сообществу бесплатно, мы надеемся расширить использование структур и моделей белков при планировании экспериментов.