Возникновение клона Salmonella enterica серовара Typhi с экстремальной лекарственной устойчивостью, несущего конъюгативную плазмиду, кодирующую устойчивость к фторхинолонам и цефалоспоринам третьего поколения

Антибиотикорезистентность является серьезной проблемой для Salmonella enterica серовара Typhi — возбудителя брюшного тифа. Изоляты с множественной лекарственной устойчивостью (MDR) широко распространены в некоторых регионах Азии и Африки и часто связаны с доминирующим гаплотипом H58. Сниженная чувствительность к фторхинолонам также широко распространена; кроме того, сообщалось о спорадических случаях устойчивости к цефалоспоринам третьего поколения или азитромицину. В настоящей работе мы сообщаем о первом крупномасштабном возникновении и распространении нового клона S. Typhi, несущего устойчивость к трем препаратам первой линии (хлорамфениколу, ампициллину и триметоприм-сульфаметоксазолу), а также к фторхинолонам и цефалоспоринам третьего поколения в провинции Синд, Пакистан; этот клон классифицирован нами как обладающий экстремальной лекарственной устойчивостью (XDR). С ноября 2016 года в провинции Синд, Пакистан, зарегистрировано более 300 случаев брюшного тифа, вызванного XDR-штаммами. Кроме того, недавно в Соединенном Королевстве был выявлен единичный случай XDR-тифа, связанный с поездкой. Полногеномное секвенирование более 80 XDR-изолятов выявило их выраженную генетическую клональность и сохранность последовательностей, большое число детерминант устойчивости, а также показало, что эти изоляты относятся к гаплотипу H58. Клон XDR S. Typhi кодирует хромосомно локализованный регион устойчивости и несет плазмиду, кодирующую дополнительные элементы устойчивости, включая β-лактамазу расширенного спектра blaCTX-M-15 и ген устойчивости к фторхинолонам qnrS. Эта плазмида IncY, ассоциированная с антибиотикорезистентностью, демонстрировала высокую идентичность последовательности с плазмидами, обнаруженными у других кишечных бактерий, выделенных в географически удаленных регионах. Исследование подчеркивает три вызывающие обеспокоенность проблемы: сокращение арсенала антибиотиков для лечения брюшного тифа, способность S. Typhi за один этап переходить от MDR к XDR путем приобретения плазмиды и способность XDR-клонов распространяться по всему миру. ВАЖНОСТЬ: Брюшной тиф — тяжелое заболевание, вызываемое грамотрицательной бактерией Salmonella enterica серовара Typhi. Анти...