Моделирование структуры миоглобина в рамках абелевой модели Хиггса

Modeling the Structure of Myoglobin within the Abelian Higgs Model
S. D. Liubimov, N. V. Gerasimeniuk, A. A. Korneev, A. V. Molochkov
2025-11-14

гетерогенное внешнее электрическое полеобратная реконструкция полярешеточная абелева модель Хиггсамоделирование миоглобинатретичная структура белка
Анализ многоатомных систем на основе первых принципов требует больших вычислительных ресурсов и потому требует выделения интегральных степеней свободы. Мы предлагаем использовать решеточную абелеву модель Хиггса для изучения структуры и динамики белков. На первом этапе в этой модели мы ввели неоднородное внешнее электрическое поле и показали, как это поле влияет на третичную структуру белка. На втором этапе мы определили вид внешнего поля, соответствующего нативной структуре белка с экспериментальной точностью. Мы полагаем, что этот подход позволит моделировать динамику белков в зависимости от внешних условий.
1
Была найдена конфигурация внешнего поля, воспроизводящая нативную структуру миоглобина с экспериментальной точностью.
2
Введение неоднородного внешнего электрического поля в модель изменяет третичную структуру белка, что демонстрирует зависимость структуры от поля.
3
Подход позволяет моделировать динамику белков при различных внешних условиях, потенциально снижая вычислительные затраты по сравнению с методами от первых принципов.
4
Латичная модель Абелевой Хиггса может быть использована для изучения структуры и динамики белков как представление через интегральные степени свободы для многоатомных систем.

Миоглобин, смоделированный в решётчатой абелевой модели Хиггса

Влияние и определение неоднородных внешних электрических полей на третичную структуру белка и поиск конфигураций поля, воспроизводящих нативную структуру с экспериментальной точностью

Publication Details
Publication Date
2025-11-14
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
1
Access Type
Author Information
Authors
S. D. Liubimov
N. V. Gerasimeniuk
A. A. Korneev
A. V. Molochkov
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%