Деревья и сети до и после Дарвина

Хорошо известно, что Чарльз Дарвин набросал абстрактные деревья родства в своей записной книжке 1837 года и изобразил дерево в труде «Происхождение видов» (1859). В настоящей работе я пытаюсь рассмотреть дарвиновские деревья в историческом контексте. К середине XVIII века Великая цепь бытия все чаще воспринималась как неадекватное описание порядка в природе, а примерно к 1780 году от нее в значительной степени отказались, не достигнув согласия относительно удовлетворительной альтернативы. В 1750 году Донати описал водные и наземные организмы как образующие сеть, а несколько лет спустя Бюффон изобразил сеть генеалогических связей между породами собак. В 1764 году Бонне задался вопросом, не может ли Цепь действительно разветвляться в определенных точках, а в 1766 году Паллас предположил, что градации между организмами напоминают дерево со сложным стволом, возможно, не столь отличное от дерева животной жизни, позднее изображенного Эйхвальдом. Другие деревья были представлены Ожье в 1801 году и Ламарком в 1809 и 1815 годах; два последних автора исходили из предположения о трансмутации видов с течением времени. В конце XVIII и самом начале XIX века были изображены сложные сети родства между растениями и между животными. В течение двух десятилетий, непосредственно предшествовавших 1837 году, так называемые родства и/или аналогии между организмами представлялись в виде разнообразных геометрических фигур. Ряды окаменелостей растений и животных в последовательных геологических слоях были представлены в виде деревьев в популярном учебнике 1840 года, а в 1858 году Бронн представил систему животных, подтверждаемую палеонтологической летописью, в форме дерева. Дерево Дарвина 1859 года и его последующие разработки Геккелем были приняты во многих, но не во всех областях биологических наук, тогда как в других использовались сетевые диаграммы. Начиная с начала 1960-х годов деревья реконструировали на основе последовательностей белков и нуклеиновых кислот, однако в середине 1990-х годов сети были вновь введены для представления латерального переноса генов, который все чаще рассматривался как фундаментальный способ эволюции, по крайней мере у бактерий и архей. Таким образом, в историческом контексте Сеть жизни предшествовала Дереву жизни и, возможно, вновь его вытеснит.