Модели мутации–отбора, точно решаемые методами статистической механики

Mutation–selection models solved exactly with methods of statistical mechanics
Ellen Baake, Holger Wagner
2001-08-01

квантовая цепочка Изингапорог ошибокмутационная нагрузкамутационно-селекционные моделиквантовая статистическая механика
Мы рассматриваем детерминированные модели мутации и отбора, действующих на популяции последовательностей, или, что эквивалентно, многолокусные системы с полным сцеплением. Точных аналитических результатов для таких систем немного; мы представляем недавние и новые результаты, полученные с помощью методов квантовой статистической механики. Мы рассматриваем модель в непрерывном времени для бесконечной популяции гаплоидов (или диплоидов без доминирования), каждый из которых имеет N сайтов, по два состояния на сайт, симметричную мутацию и произвольную функцию приспособленности. Мы показываем, что эта модель в точности эквивалентна так называемой квантовой цепочке Изинга. В этой интерпретации приспособленность соответствует энергии взаимодействия спинов, а мутация — параметру, подобному температуре. Сложные методы статистической механики позволяют находить точные решения для нетривиальных примеров. К ним относятся квадратичные функции приспособленности, а также «ландшафт Онсагера». Последний представляет собой функцию приспособленности, отражающую некоторые существенные особенности молекулярной эволюции, такие как нейтральность, компенсаторные мутации и плоские гребни. Мы исследуем среднее число мутаций, мутационный груз и дисперсию приспособленности в условиях равновесия мутаций и отбора. Это также позволяет глубже понять явление «порог ошибки», которое наблюдается в некоторых, но не во всех, примерах.
1
Получены точные решения для нетривиальных ландшафтов, включая квадратичные функции приспособленности и ландшафт Онсагера.
2
В рамках отображения на статистическую механику приспособленность соответствует энергии взаимодействия спинов, а мутация — параметру, аналогичному температуре.
3
Ландшафт Онсагера моделирует такие особенности эволюции, как нейтральность, компенсаторные мутации и плоские гребни приспособленности.
4
Модель мутации–отбора в непрерывном времени точно эквивалентна квантовой цепочке Изинга для гаплоидных популяций с симметричной мутацией и произвольной приспособленностью.
5
Подход позволяет вычислять число мутаций, мутационную нагрузку и дисперсию приспособленности при мутационно-селекционном равновесии, объясняя, почему порог ошибок возникает не для всех ландшафтов.

Детерминированные системы мутации–отбора для бесконечных популяций гаплоидных последовательностей (или полностью сцепленных многолокусных систем) с N двусостояниями на сайтах

Точные свойства равновесия мутации–отбора, включая среднее число мутаций, мутационную нагрузку, дисперсию приспособленности и возникновение порога ошибок, при симметричной мутации и произвольных функциях приспособленности

Publication Details
Publication Date
2001-08-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Ellen Baake
Holger Wagner
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%