Исследование промискуитета реакционных путей дижелезной оксигеназы AetD

Exploring Reaction Pathway Promiscuity of Diiron Oxygenase AetD
Wen‐Chao Geng, Wenzhao Wang, Bian Wu, Huan Zhang, Tong Zhu, Shiming Tang, Xuexian Cui, J Liu, Cuiping Pang, Jinyuan Sun, 崔颖鹿, Jiahai Zhou, Binju Wang
2026-06-16

3'-C функционализированные индольные производныеAetDFe2(IV)=OQM/MM моделированиедижелезный (III, IV) X видгемоксигеназоподобные ди-железные оксидазыперенос атома водородаизотопная маркировканитрилобразующая ферментамногообразие реакционных путей
Диоксигеназы с дижелезным центром, сходные по структуре с гемоксидазами (HDO), представляют собой расширяющуюся суперсемейство с сложными и разнообразными каталитическими функциями. Среди них AetD была идентифицирована как фермент, формирующий нитрил, хотя её каталитический механизм остаётся плохо изученным. В данном исследовании показана неожиданная промискуитет реакционных путей AetD, демонстрирующая её способность превращать (бромсодержащий) l-триптофан не только в индол-3-карбонитрил, но и в ряд 3′-C-функционализированных индольных производных, включая амин, спирт, альдегид и карбоновую кислоту. Анализ распределения продуктов, их взаимопревращений, экспериментов с изотопной маркировкой и QM/MM-симуляций показывает, что высокореактивный дижелезный (III,IV) X-вид с фрагментом Fe2(IV)=O способен инициировать перенос атома водорода с различных участков субстрата. Эти результаты подчёркивают, как гибкая дижелезная структура AetD обеспечивает разнообразные преобразования функциональных групп, делая этот фермент мощным каталитическим инструментом для сложных и трудновыполнимых биопревращений.
1
AetD превращает (бромзамещённый) l-триптофан не только в индол-3-нитрил, но и в 3'-C-функционализированные индолы: амин, спирт, альдегид и карбоновую кислоту.
2
Механистическая универсальность AetD делает его перспективным каталитическим инструментом для сложных и трудных биотрансформаций, включающих C3'-функционализацию индолов.
3
AetD, дижелезный окисляющий фермент, похожий на гемовый оксидазу (HDO), демонстрирует неожиданную промискуитетность реакционных путей, превращая производные l-триптофана в несколько типов продуктов.
4
Анализ распределения продуктов, эксперименты по взаимопревращениям, изотопная маркировка и QM/MM-симуляции указывают, что единый высокореактивный дижелезный (III,IV) X-вид с Fe2(IV)=O инициирует отрыв атома водорода с различных сайтов субстрата.
5
Гибкая дижелезная структура AetD позволяет абстракцию атома водорода в разных положениях, обеспечивая разнообразные трансформации функциональных групп.

Диферросодержащая оксигеназа AetD (фермент)

Многообразие реакционных путей: способность фермента инициировать перенос атома водорода реактивным диферроспецией (Fe2(III,IV) с фрагментом Fe2(IV)=O), приводящая к преобразованию l-триптофана (и бромозамещённых аналогов) в индол-3-нитрил и различные 3'-C-функционализованные индоловые производные (амин, спирт, альдегид, карбоновая кислота); механистические детерминанты, выявленные по распределениям продуктов, их взаимопревращениям, изотопному меткам и QM/MM-симуляциям

Publication Details
Publication Date
2026-06-16
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
0
Access Type
Author Information
Authors
Wen‐Chao Geng
Wenzhao Wang
Bian Wu
Huan Zhang
Tong Zhu
Shiming Tang
Xuexian Cui
J Liu
Cuiping Pang
Jinyuan Sun
崔颖鹿
Jiahai Zhou
Binju Wang
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%