Генетический автостоп при положительном дарвиновском отборе

Положительный отбор можно выявить по его влиянию на связанную нейтральную изменчивость. В предельном случае отсутствия рекомбинации вся связанная изменчивость устраняется. Если рекомбинация происходит, но редко, как детерминированные, так и стохастические модели положительного отбора показывают, что связанная изменчивость перемещается генетическим автостопом к низким или высоким частотам. Хотя на распределение частот изменчивости может влиять ряд эволюционных процессов, избыток производных вариантов с высокой частотой представляет собой уникальную картину, создаваемую генетическим автостопом (производным называется состояние, не являющееся предковым, что определяется по внешней группе). Мы используем статистику H для измерения избытка вариантов с высокой частотой по сравнению с вариантами с промежуточной частотой. Для обнаружения генетического автостопа достаточно всего нескольких вариантов с высокой частотой, поскольку при нейтральной эволюции ожидается их небольшое количество. Это особенно полезно в областях с низкой рекомбинацией, где изменчивость невелика, а также в областях с нормальной или высокой рекомбинацией, где эффект генетического автостопа может быть ограничен небольшим участком (<1 т.п.н.). Применение теста H к опубликованным исследованиям изменчивости Drosophila выявляет избыток вариантов с высокой частотой, на которые, вероятно, повлиял положительный отбор.