Кластерный анализ и визуализация паттернов экспрессии генома в масштабе всего генома

Описана система кластерного анализа для данных о экспрессии генов в масштабе всего генома, полученных методом гибридизации на ДНК-микрочипах, которая использует стандартные статистические алгоритмы для упорядочивания генов в соответствии со сходством паттернов их экспрессии. Результаты отображаются графически, передавая информацию о кластерах и исходных данных экспрессии одновременно в форме, интуитивно понятной для биологов. На дрожжах Saccharomyces cerevisiae мы обнаружили, что кластеризация данных экспрессии эффективно группирует гены с известными сходными функциями, и наблюдаем аналогичную тенденцию в данных человека. Таким образом, паттерны, выявляемые в экспериментах по экспрессии в масштабе всего генома, можно интерпретировать как указания на состояние клеточных процессов. Кроме того, коэкспрессия генов с известной функцией и плохо охарактеризованных или новых генов может дать простой путь к получению подсказок о функциях многих генов, по которым в настоящее время нет информации.