Пересмотр подходов к поиску биомаркеров с помощью протеомики плазмы

Клинический анализ крови является наиболее распространенной диагностической процедурой в медицине, а биомаркеры крови используются для классификации пациентов и поддержки принятия решений о лечении. Однако существующие биомаркеры далеко не охватывают все необходимые клинические задачи, часто обладают недостаточной специфичностью, а новые биомаркеры разрабатываются очень медленно. Как описано в этом обзоре, протеомика на основе масс-спектрометрии (MS) стала мощным инструментом биологических исследований и теперь позволяет детально охарактеризовать протеом плазмы. Предыдущие «треугольные стратегии» были направлены на выявление отдельных кандидатов в биомаркеры в небольших когортах с последующим использованием классических иммуноанализов в значительно более крупных когортах для валидации. Мы предлагаем «прямоугольную» стратегию профилирования протеома плазмы, в рамках которой паттерны протеома в крупных когортах сопоставляются с их фенотипами в норме и при заболеваниях. Перенос таких концепций в клиническую практику потребует перестройки ряда аспектов принятия диагностических решений; в статье обсуждаются некоторые первые шаги в этом направлении.