QuPath: программное обеспечение с открытым исходным кодом для анализа изображений в цифровой патологии

QuPath: Open source software for digital pathology image analysis
Peter Bankhead, Manuel Salto‐Tellez, Jacqueline A. James, Maurice B. Loughrey, Helen G. Coleman, Liam Murray, Yvonne Dombrowski, José A. Fernández, Peter W. Hamilton, Philip D. Dunne, Darragh G. McArt, Stephen McQuaid, Ronan T. Gray
2017-11-28

QuPathпакетная обработкаоценка биомаркеровцифровая патологияанализ изображений целых предметных стекол
QuPath — это новое программное обеспечение для анализа биоизображений, разработанное для удовлетворения растущей потребности в удобном для пользователя, расширяемом решении с открытым исходным кодом для цифровой патологии и анализа полноразмерных изображений гистологических срезов. Помимо широкого набора инструментов для идентификации опухолей и высокопроизводительной оценки биомаркеров, QuPath предоставляет исследователям мощные средства пакетной обработки и написания скриптов, а также расширяемую платформу для разработки и совместного использования новых алгоритмов анализа сложных изображений тканей. Кроме того, гибкая архитектура QuPath делает его подходящим для широкого спектра дополнительных задач анализа изображений в биомедицинских исследованиях.
1
Расширяемая архитектура позволяет исследователям разрабатывать и распространять новые алгоритмы анализа биомедицинских изображений.
2
QuPath представлен как удобная, расширяемая платформа с открытым исходным кодом для цифровой патологии и анализа полноразмерных гистологических изображений.
3
QuPath поддерживает пакетную обработку и написание скриптов, обеспечивая масштабируемые и автоматизированные рабочие процессы анализа изображений.
4
Гибкая платформа применима не только в цифровой патологии, но и в широком спектре задач биомедицинских исследований.
5
Программное обеспечение включает инструменты идентификации опухолей и высокопроизводительной оценки биомаркеров для анализа сложных тканевых изображений.

Открытое программное обеспечение QuPath для биоизображений, предназначенное для цифровой патологии и анализа целых слайдов

удобный для пользователя, расширяемый анализ изображений с открытым исходным кодом для идентификации опухолей, высокопроизводительной оценки биомаркеров и анализа сложных изображений тканей

Publication Details
Publication Date
2017-11-28
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Peter Bankhead
Manuel Salto‐Tellez
Jacqueline A. James
Maurice B. Loughrey
Helen G. Coleman
Liam Murray
Yvonne Dombrowski
José A. Fernández
Peter W. Hamilton
Philip D. Dunne
Darragh G. McArt
Stephen McQuaid
Ronan T. Gray
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%