Биоразнообразие и метаболические свойства бактериальных сообществ пищеварительной системы двустворчатого моллюска Crenomytilus grayanus

С использованием метабаркодинга исследовано биоразнообразие бактериальных сообществ пищеварительной системы Crenomytilus grayanus, обитающего в прибрежных водах Японского моря, подвергающихся хроническому антропогенному загрязнению. Помимо морских бактерий, в микробиоте выявлены таксоны, обычно ассоциированные с загрязнением нефтью (Rhodobacteraceae, Corynebacteriaceae), тяжелыми металлами (Asinibacterium) и неочищенными бытовыми стоками (Cloacibacterium, Globicatella). Проведена таксономическая характеристика коллекции из 411 культивируемых гетеротрофных штаммов бактерий, выделенных в ходе данного исследования. Показано, что кишечный микробиом изученных моллюсков имеет уникальный состав, зависящий от места их обитания. Исследована способность бактериальных штаммов, выделенных из пищеварительной системы C. grayanus, разлагать различные питательные субстраты (сахара, аминокислоты и полисахариды) и ксенобиотики (нефтяные углеводороды, бисфенол А и атразин). Большинство изолятов разлагали широкий спектр органических субстратов; 13% (54 штамма) окисляли нефтяные углеводороды, 1% (4 штамма) — бисфенол А, а 0,5% (2 штамма) разлагали атразин. Обсуждается возможная роль микробиома C. grayanus в симбиотическом пищеварении и детоксикации моллюска.